RNA–Protein interactions for RNA: YPR057W

BRR1, Transcript of snRNP protein component of spliceosomal snRNPs, yeastyeast

Gene BRR1, Length 1,026 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRR1YPR057W YHR045WP38775 560 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W UTP9P38882 575 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data9.29□□□□□ -0.92not detected
BRR1YPR057W ERG10P41338 398 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W IAH1P41734 238 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W VEL1P53058 206 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W ERP6P53198 216 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W COG2P53271 262 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W YML131WQ03102 365 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W YDR344CQ05510 147 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W LCB5Q06147 687 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W BCP1Q06338 283 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W YEH2Q07950 538 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W IRC10Q08118 586 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W RSB1Q08417 382 aa9.29□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W PDC5P16467 563 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W VPS34P22543 875 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W DBR1P24309 405 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W SIN4P32259 974 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W PTC1P35182 281 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W DOT6P40059 670 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W REF2P42073 533 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W GLG2P47011 380 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W YJR154WP47181 346 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W PYK2P52489 506 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W FLC3P53121 802 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W NMA2P53204 395 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W VAC7P53950 1165 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W PRO2P54885 456 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W VAM6Q07468 1049 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W TGL5Q12043 749 aa9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W CMR1Q12510 522 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
BRR1YPR057W APA1P16550 321 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W BUB2P26448 306 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SFP1P32432 683 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SPS19P32573 292 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W PRP18P33411 251 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W PXA2P34230 853 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YEN1P40028 759 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W MEP1P40260 492 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YRB1P41920 201 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SET2P46995 733 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SHY1P53266 389 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YNR065CP53751 1116 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W PEX13P80667 386 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W PML39Q03760 334 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W PPN1Q04119 674 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W HFD1Q04458 532 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W RIF2Q06208 395 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W VTA1Q06263 330 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W CDA1Q06702 301 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W MCH5Q08777 521 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W GPB1Q08886 897 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W FLC1Q08967 793 aa9.27□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W TRP3P00937 484 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W RAM1P22007 431 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SAN1P22470 610 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W UBA1P22515 1024 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W MEF1P25039 761 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W BRF1P29056 596 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SWE1P32944 819 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W TIP20P33891 701 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W HES1P35843 434 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W LRP1P38801 184 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W MAM33P40513 266 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W IRR1P40541 1150 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W EMC4P53073 190 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W FRE4P53746 719 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W ATP25Q03153 612 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YMR178WQ03219 274 aaKnown RBP9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W TRM12Q04235 462 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W CIA1Q05583 330 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SGO1Q08490 590 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W BUD7Q08754 746 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YLR049CQ12110 428 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YOR012WQ12351 137 aa9.26□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W RPL24AP04449 155 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W GUK1P15454 187 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W PHO87P25360 923 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YJU3P28321 313 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W ZIP1P31111 875 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YBL029WP38201 376 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W TIM17P39515 158 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W DHH1P39517 506 aaKnown RBP9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W MET18P40469 1032 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W OYE3P41816 400 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SUM1P46676 1062 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W TIS11P47977 285 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W IMA1P53051 589 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W NPL3Q01560 414 aaKnown RBP RIP-Chip data9.25□□□□□ -0.93not detected
BRR1YPR057W SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W YLR413WQ06689 675 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W GTT2Q12390 233 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W TY4A-HQ6Q5P6 413 aa9.25□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W ATP2P00830 511 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SPT3P06844 337 aa9.24□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W COS2P0CX12 379 aa9.24□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W COS3P0CX13 379 aa9.24□□□□□ -0.93
BRR1YPR057W SEC63P14906 663 aa9.24□□□□□ -0.93
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