RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	RAD33	Q04231	177 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	GYL1	Q04322	720 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	RLM1	Q12224	676 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	LSP1	Q12230	341 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	CYB2	P00175	591 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.05	□□□□□ -1.76	not detected
RTS1	YOR014W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ERV1	P27882	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PUP2	P32379	260 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SEC66	P33754	206 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	GMH1	P36125	273 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	MED8	P38304	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SUL1	P38359	859 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PIH1	P38768	344 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	AFG3	P39925	761 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PHM8	P40025	321 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ARG2	P40360	574 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	NDC80	P40460	691 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	BOP3	P53958	396 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	NDL1	Q06568	189 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ARR1	Q06596	294 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ATG9	Q12142	997 aa		4.05	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SNT1	P25357	1226 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	BUD14	P27637	709 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ECM10	P39987	644 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	MIT1	P40002	666 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.04	□□□□□ -1.76	not detected
RTS1	YOR014W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	COQ6	P53318	479 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	AFI1	Q99222	893 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	WHI2	P12611	486 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	CPR2	P23285	205 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	AAD3	P25612	363 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PAP1	P29468	568 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SEF1	P34228	1148 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	GIP4	P39732	760 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	MEP1	P40260	492 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	COG2	P53271	262 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	EFM6	P53970	246 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PLM2	Q04383	521 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	HRD3	Q05787	833 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	RTT109	Q07794	436 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	CUE5	Q08412	411 aa	Known RBP	4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	GPM3	Q12326	303 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.04	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	MRP13	P12686	339 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	REC107	P21651	314 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	HCM1	P25364	564 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PRD1	P25375	712 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ADH7	P25377	361 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PCL5	P38794	229 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	HXT14	P42833	540 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	YJL055W	P47044	245 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	SOV1	Q04748	898 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	ORM2	Q06144	216 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	YOL159C	Q08300	171 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	APC5	Q08683	685 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	APC2	Q12440	853 aa		4.03	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	BRF1	P29056	596 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	PSO2	P30620	661 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	CBR1	P38626	284 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	UIP3	P39547	235 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	ALG5	P40350	334 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	DIA3	P52290	468 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	FIN1	Q03898	291 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	ARG7	Q04728	441 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	INP53	Q12271	1107 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	SEC39	Q12745	709 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	MGM1	P32266	881 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	YBR144C	P34215	104 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	KDX1	P36005	433 aa		4.02	□□□□□ -1.77
RTS1	YOR014W	YMC2	P38087	329 aa		4.02	□□□□□ -1.77

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