RNA–Protein interactions for RNA: YNL089C

YNL089C, Transcript of Dubious open reading frame unlikely to encode a functional protein, yeast

Gene YNL089C, Length 477 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL089C	YNL089C	SYN8	P31377	255 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MFT1	P33441	392 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	OCT1	P35999	772 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YEL057C	P39983	233 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ORC5	P50874	479 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	DIA3	P52290	468 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YTP1	P53584	459 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MAK10	Q02197	733 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	PFA4	Q12006	378 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	CRC1	Q12289	327 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.21	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	RAP1	P11938	827 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	CLB2	P24869	491 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ROX1	P25042	368 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ADH7	P25377	361 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ERG3	P32353	365 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	NFU1	P32860	256 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ARN1	P38731	627 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	BUR6	P40096	142 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SGN1	P40561	250 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.2	□□□□□ -1.9	not detected
YNL089C	YNL089C	YJL107C	P42947	387 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	EFM6	P53970	246 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	RPT6	Q01939	405 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	PFA5	Q03289	374 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	NUP53	Q03790	475 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	PIG1	Q06216	648 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MCH4	Q08268	501 aa		3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	3.2	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SGS1	P35187	1447 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	GAL4	P04386	881 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MET17	P06106	444 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	RED1	P14291	827 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	CKA1	P15790	372 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	PUP3	P25451	205 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	PEP3	P27801	918 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MGM1	P32266	881 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MSS51	P32335	436 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	NPL6	P32832	435 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	REG2	P38232	338 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ARP1	P38696	384 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	VPS41	P38959	992 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ELO1	P39540	310 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MET18	P40469	1032 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MET28	P40573	187 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ARF3	P40994	183 aa	RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
YNL089C	YNL089C	MAF1	P41910	395 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	VTC2	P43585	828 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ASI1	P54074	624 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YLR287C	Q05881	355 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	PDR8	Q06149	701 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	RTN2	Q12443	393 aa		3.19	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
YNL089C	YNL089C	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	LCB1	P25045	558 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YCR006C	P25350	157 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	COQ3	P27680	312 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YKL050C	P35736	922 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	NUP133	P36161	1157 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	CFD1	P40558	293 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	IRC7	P43623	340 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YGR066C	P53242	292 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	NNF2	P53253	936 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	JJJ1	P53863	590 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SPC19	Q03954	165 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	DPB4	Q04603	196 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	GRX6	Q12438	231 aa		3.18	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YMR085W	P0CF18	432 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	MRP13	P12686	339 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	TSC10	P38342	320 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	AFG3	P39925	761 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	SMC3	P47037	1230 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	VID30	P53076	958 aa		3.17	□□□□□ -1.9
YNL089C	YNL089C	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 31.6 ms