RNA–Protein interactions for RNA: YKL111C

YKL111C, Transcript of Dubious open reading frame, yeastyeast

Gene YKL111C, Length 336 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKL111CYKL111C SCS3P53012 380 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YNL181WP53878 407 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YSA1Q01976 231 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C NUP100Q02629 959 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C CTL1Q03220 320 aaKnown RBP2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ATG26Q06321 1198 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C MCP2Q06567 569 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C OPY2Q06810 360 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RPS10AQ08745 105 aaPredicted RBP2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C NKP1Q12493 238 aa2.54□□□□□ -2
YKL111CYKL111C HNM1P19807 563 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SYN8P31377 255 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C PDR3P33200 976 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C TSC10P38342 320 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ANS1P38832 159 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C ELO1P39540 310 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C BUR6P40096 142 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C SGM1P47166 707 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RPS7BP48164 190 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C TMA64Q04600 565 aaKnown RBP2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C YDL218WQ07629 317 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C BSC1Q12140 328 aa2.53□□□□□ -2
YKL111CYKL111C RPS2P25443 254 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C GID7P25569 745 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C DPB3P27344 201 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C SSH4P32343 579 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C MUD2P36084 527 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C SPC34P36131 295 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YER130CP39959 443 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C STB2P46679 850 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C GUF1P46943 645 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C PYK2P52489 506 aaKnown RBP2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C NNF2P53253 936 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C BSC5P53755 489 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RAD30Q04049 632 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C FMP42Q04991 504 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RSF1Q05043 376 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YLR281CQ05863 155 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C NBP2Q12163 236 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C SPE4Q12455 300 aa2.52□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C PUT2P07275 575 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C CDC16P09798 840 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C SNF3P10870 884 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C BAR1P12630 587 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RPB8P20436 146 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C KGD1P20967 1014 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C SGV1P23293 657 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C MTR2P34232 184 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C GCS1P35197 352 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YKL050CP35736 922 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C VRG4P40107 337 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C IAH1P41734 238 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C ATG27P46989 271 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C SOL4P53315 255 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YNL234WP53857 426 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C MSC1Q03104 513 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C PSR1Q07800 427 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C NRT1Q08485 598 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C APL4Q12028 832 aa2.51□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YCK1P23291 538 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C LCB1P25045 558 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C PUP3P25451 205 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C CHS3P29465 1165 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C MAL33P38157 468 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RKM3P38222 552 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C CCT6P39079 546 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C VID27P40157 782 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RGI2P40188 164 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C MAF1P41910 395 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C UPF3P48412 387 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C APT1P49435 187 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C ERG26P53199 349 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C EFM6P53970 246 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C NGL3Q03210 505 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C GRC3Q07845 632 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YDR056CQ12025 205 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C NCE102Q12207 173 aaRIP-Chip data2.5□□□□□ -2.01not detected
YKL111CYKL111C SKM1Q12469 655 aa2.5□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C ARD1P07347 238 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C BUD5P25300 642 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C ADH7P25377 361 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RPN2P32565 945 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RAD24P32641 659 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C AUR1P36107 401 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C NUP133P36161 1157 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C STV1P37296 890 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C ERG7P38604 731 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RTS1P38903 757 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YEL068CP39977 110 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YAT2P40017 923 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C YIR014WP40570 242 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C LYS14P40971 790 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C DIA3P52290 468 aa2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C DUO1P53168 247 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C DRN1P53255 507 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C RPC11Q04307 110 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
YKL111CYKL111C EMI2Q04409 500 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 16.8 ms