RNA–Protein interactions for RNA: YHR081W

LRP1, Transcript of Nuclear exosome-associated nucleic acid binding protein, yeast

Gene LRP1, Length 555 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
LRP1	YHR081W	ATG26	Q06321	1198 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TIP41	Q12199	356 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		3.15	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	GID7	P25569	745 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TRS65	P32893	560 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PHO90	P39535	881 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YLR352W	Q06479	807 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PSR2	Q07949	397 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TAH18	Q12181	623 aa		3.14	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SNF3	P10870	884 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	GLN3	P18494	730 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	GAC1	P28006	793 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	CBF2	P32504	956 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RGT1	P32862	1170 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	ERG7	P38604	731 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	LYS4	P49367	693 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	CUL3	P53202	744 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	CBK1	P53894	756 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RSF1	Q05043	376 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SSP2	Q08646	371 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RDR1	Q08904	546 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	APL4	Q12028	832 aa		3.13	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PHO2	P07269	559 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PWP1	P21304	576 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RRN3	P36070	627 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RTT107	P38850	1070 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YER130C	P39959	443 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YJR061W	P40355	935 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SOL4	P53315	255 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	ZDS2	P54786	942 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	INA17	Q02888	182 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	VMS1	Q04311	632 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	FMP45	Q07651	309 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	GRC3	Q07845	632 aa		3.12	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RPS2	P25443	254 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YKL050C	P35736	922 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PHD1	P36093	366 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RIM2	P38127	377 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	UBA4	P38820	440 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	ELO1	P39540	310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	UIP3	P39547	235 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YIR014W	P40570	242 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SMC3	P47037	1230 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	AAD10	P47182	288 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RAD30	Q04049	632 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RTT109	Q07794	436 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PSR1	Q07800	427 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	DAP1	Q12091	152 aa		3.11	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TSC10	P38342	320 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	GUF1	P46943	645 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SIP4	P46954	829 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	EMI2	Q04409	500 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	DIC1	Q06143	298 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YOR111W	Q99210	232 aa		3.1	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SYN8	P31377	255 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	SPC34	P36131	295 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	MAL33	P38157	468 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	DBP8	P38719	431 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YJL070C	P40361	888 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	LYS14	P40971	790 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	DIA3	P52290	468 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	GIS2	P53849	153 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.09	□□□□□ -1.91	RIP-Chip
LRP1	YHR081W	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RSM23	Q01163	450 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	YSA1	Q01976	231 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	RBA50	Q04418	439 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	ECM30	Q06673	1274 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	TEN1	Q07921	160 aa		3.09	□□□□□ -1.91
LRP1	YHR081W	PUT2	P07275	575 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	YML002W	P0CF17	737 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	MRS3	P10566	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	PMS1	P14242	873 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SPE2	P21182	396 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ACH1	P32316	526 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	ROT2	P38138	954 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	RGI2	P40188	164 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	AXL1	P40851	1208 aa		3.08	□□□□□ -1.92
LRP1	YHR081W	SGM1	P47166	707 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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