RNA–Protein interactions for RNA: YHR069C

RRP4, Transcript of Exosome non-catalytic core component, yeast

Gene RRP4, Length 1,080 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RRP4	YHR069C	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YDR109C	Q04585	715 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	NUT2	Q06213	157 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	OMS1	Q06668	471 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ADY3	Q07732	790 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RGS2	Q99188	309 aa		5.71	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YMR085W	P0CF18	432 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	AMD2	P22580	549 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SPS19	P32573	292 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YSW1	P38280	609 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YBR259W	P38338	688 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	BOL3	P39724	118 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YJR061W	P40355	935 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HOS4	P40480	1083 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	NUP84	P52891	726 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ARP4	P80428	489 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PPN1	Q04119	674 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HPF1	Q05164	967 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	NUS1	Q12063	375 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	GNT1	Q12096	491 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	UPC2	Q12151	913 aa		5.7	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	TOR2	P32600	2474 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	APA1	P16550	321 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HCM1	P25364	564 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	AAD3	P25612	363 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ISC10	P32645	267 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	THI80	P35202	319 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RIM2	P38127	377 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	MUP3	P38734	546 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	WSC4	P38739	605 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YHR182W	P38870	785 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PIK1	P39104	1066 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YJL206C	P39529	758 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HAT2	P39984	401 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PET130	P47065	347 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CAF120	P53836	1060 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YNL058C	P53947	316 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	UBX4	P54730	416 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SMA1	Q02651	245 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YLR177W	Q06251	628 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	VHS3	Q08438	674 aa		5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.69	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RAD3	P06839	778 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SFP1	P32432	683 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PHA2	P32452	334 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	RML2	P32611	393 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YSC84	P32793	468 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	TFC3	P34111	1160 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YBR062C	P38239	180 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	IML3	P38265	245 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PHO89	P38361	574 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	DBP8	P38719	431 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PCL5	P38794	229 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YHR078W	P38799	552 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	FMO1	P38866	432 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YDR089W	P38966	869 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	DSN1	P40568	576 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	IME4	P41833	600 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	TDA10	P42938	290 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	GAT1	P43574	510 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	NBP35	P52920	328 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SWC4	P53201	476 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YMR155W	Q03795	547 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CSN9	Q03981	162 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	TAF11	Q04226	346 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CIA1	Q05583	330 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ATG10	Q07879	167 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YDL176W	Q12027	708 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	APC9	Q12107	265 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	UBX3	Q12229	455 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ICT1	Q12385	394 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	YPL247C	Q12523	523 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	MSB2	P32334	1306 aa		5.68	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PHO5	P00635	467 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	ABF1	P14164	731 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	MRPL33	P20084	86 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CIN8	P27895	1000 aa		5.67	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.67	□□□□□ -1.5
RRP4	YHR069C	PTM1	P32857	523 aa		5.67	□□□□□ -1.5

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