RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPH1	P39956	796 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YER186C	P40101	306 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	JEM1	P40358	645 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	EFM4	P40516	257 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SNZ3	P43545	298 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	TAH11	P47112	604 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	BIR1	P47134	954 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YGR237C	P50089	785 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	COS6	P53344	381 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SPO1	P53541	631 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SNZ2	P53824	298 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	EGD1	Q02642	157 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	NGL3	Q03210	505 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	FCP1	Q03254	732 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RNH1	Q04740	348 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	PIG1	Q06216	648 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YPS7	Q06325	596 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YDL114W	Q07530	308 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YOL057W	Q08225	711 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SUT2	Q12286	268 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	NCA2	Q12374	616 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	EMP46	Q12396	444 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VMR1	P38735	1592 aa		3.45	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SSB1	P11484	613 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ABF1	P14164	731 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ISY1	P21374	235 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ATP12	P22135	325 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DBF2	P22204	572 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	PWP2	P25635	923 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SEC65	P29478	273 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ITR1	P30605	584 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ZIP1	P31111	875 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	PMT1	P33775	817 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	TPO5	P36029	618 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SET3	P36124	751 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	CTP1	P38152	299 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	TDP1	P38319	544 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RCY1	P39531	840 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	AST2	P39945	430 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SSB2	P40150	613 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ALG5	P40350	334 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RIC1	P40395	1056 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YIL077C	P40508	320 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	BUD8	P41698	603 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	TDA10	P42938	290 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SWP82	P43554	623 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	FMP33	P46998	180 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	MPS3	P47069	682 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	CTF18	P49956	741 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	MRPL50	P53724	139 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	PRO2	P54885	456 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SLT2	Q00772	484 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	MDM1	Q01846	1127 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	NSE5	Q03718	556 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VTI1	Q04338	217 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DON1	Q05610	365 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	HCR1	Q05775	265 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ADE13	Q05911	482 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DXO1	Q06349	442 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	CRN1	Q06440	651 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YFT2	Q06676	274 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	STP4	Q07351	490 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YEH2	Q07950	538 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VPS54	Q12071	889 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	BAG7	Q12128	409 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RUP1	Q12242	671 aa		3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SNU23	Q12368	194 aa	Predicted RBP	3.44	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	DNF3	Q12674	1656 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	ATP6	P00854	259 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RAP1	P11938	827 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	RAD57	P25301	460 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	FUB1	P25659	250 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	EUG1	P32474	517 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	MSS1	P32559	526 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	MRPL17	P36528	281 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	COS111	P38308	924 aa		3.43	□□□□□ -1.86
ECO1	YFR027W	MTG2	P38860	518 aa		3.43	□□□□□ -1.86

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