RNA–Protein interactions for RNA: YER116C

SLX8, Transcript of Subunit of Slx5-Slx8 SUMO-targeted ubiquitin ligase (STUbL) complex, yeast

Gene SLX8, Length 825 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SLX8	YER116C	TAF3	Q12297	353 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	GIS3	Q12418	502 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	AHC1	Q12433	566 aa		4.11	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	IKI3	Q06706	1349 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	HIP1	P06775	603 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	STE3	P06783	470 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	KSS1	P14681	368 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YME2	P32843	850 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	KKQ8	P36004	724 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	ECM4	P36156	370 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PFF1	P38244	976 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	TOS1	P38288	455 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SFB3	P38810	929 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	CCT6	P39079	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SER3	P40054	469 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YNL195C	P40168	261 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YIR014W	P40570	242 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	HXT14	P42833	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	MCM6	P53091	1017 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YNL144C	P53907	740 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	ATC1	Q04005	294 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PPN1	Q04119	674 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	UFO1	Q04511	668 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SSQ1	Q05931	657 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	BCP1	Q06338	283 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	CUR1	Q06469	252 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	VPS36	Q06696	566 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	DIB1	Q06819	143 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	AIM6	Q07716	390 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	GSH2	Q08220	491 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	ELG1	Q12050	791 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	ULA1	Q12059	462 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YOL107W	Q12239	342 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	COQ4	O13525	335 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SOD2	P00447	233 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	TRP3	P00937	484 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	RPI1	P23250	407 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	BUD14	P27637	709 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PRE2	P30656	287 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PRE4	P30657	266 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	HXT3	P32466	567 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SUA5	P32579	426 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	ELM1	P32801	640 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	NNK1	P36003	928 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	MRPL4	P36517	319 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SIP3	P38717	1229 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	BZZ1	P38822	633 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	NUP60	P39705	539 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SSO2	P39926	295 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PZF1	P39933	429 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	ELO3	P40319	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	IME4	P41833	600 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	CTK2	P46962	323 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YGL138C	P53122	345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	TWF1	P53250	332 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	NCE103	P53615	221 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	PRM1	P53835	661 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	TPP1	Q03796	238 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	DOT1	Q04089	582 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	SEG1	Q04279	960 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	BUD22	Q04347	519 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	VTA1	Q06263	330 aa		4.09	□□□□□ -1.75
SLX8	YER116C	CLC1	P17891	233 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	YIH1	P25637	258 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	RML2	P32611	393 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	LIP5	P32875	414 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	BUD2	P33314	1104 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	HCS1	P34243	683 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	SGS1	P35187	1447 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	MNL1	P38888	796 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	MLH1	P38920	769 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	SAK1	P38990	1142 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	MMM1	P41800	426 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	YJL107C	P42947	387 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	SMC3	P47037	1230 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	EFM3	P47163	339 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	COX18	P53239	316 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.08	□□□□□ -1.76	not detected
SLX8	YER116C	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	BOP2	Q06150	570 aa		4.08	□□□□□ -1.76
SLX8	YER116C	SVS1	Q12254	260 aa		4.08	□□□□□ -1.76

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