RNA–Protein interactions for RNA: YDL193W

NUS1, Transcript of Putative prenyltransferase, yeast

Gene NUS1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NUS1	YDL193W	ASG1	P40467	964 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	HOS2	P53096	452 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	TRS23	Q03784	219 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SWA2	Q06677	668 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	LCB4	Q12246	624 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	AVL9	Q12500	764 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.38	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	RAD51	P25454	400 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	MRPL9	P31334	269 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YKL100C	P34248	587 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	LHS1	P36016	881 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CST26	P38226	397 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ERC1	P38767	581 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	UIP3	P39547	235 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	NPA3	P47122	385 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	BOP3	P53958	396 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	TIM44	Q01852	431 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	UBP16	Q02863	499 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YML119W	Q03208	357 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YDR131C	Q03899	556 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ETT1	Q08421	412 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	FMP40	Q08968	688 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	HSP42	Q12329	375 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YPT6	Q99260	215 aa		4.37	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SEC7	P11075	2009 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YMR084W	A2P2R3	262 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	COX1	P00401	534 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CPA2	P03965	1118 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	AMD2	P22580	549 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ADK2	P26364	225 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SRO77	P38163	1010 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	PCL5	P38794	229 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	AFG3	P39925	761 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SSU1	P41930	458 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YGR127W	P53275	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YNL092W	P53934	400 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	FIN1	Q03898	291 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	RQC1	Q05468	723 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	VPS38	Q05919	439 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	HBT1	Q07653	1046 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ATG29	Q12092	213 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SPE4	Q12455	300 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	STH1	P32597	1359 aa		4.36	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	MF(ALPHA)1	P01149	165 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SPE2	P21182	396 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YEL057C	P39983	233 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	PKP1	P40530	394 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	FAR3	P46671	204 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SMC3	P47037	1230 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	TWF1	P53250	332 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CPR8	P53728	308 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	RSM28	Q03430	361 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	GIS1	Q03833	894 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	PLM2	Q04383	521 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YPL272C	Q08984	517 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	ACF2	Q12168	779 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	BCK1	Q01389	1478 aa		4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	NUP188	P52593	1655 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	YSP3	P25036	478 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	DMC1	P25453	334 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SYN8	P31377	255 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SEF1	P34228	1148 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CMC1	P36064	111 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	PIM1	P36775	1133 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	RFC1	P38630	861 aa	Known RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CCT6	P39079	546 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CAJ1	P39101	391 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	BUR6	P40096	142 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SWP82	P43554	623 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	BUD27	P43573	796 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.34	□□□□□ -1.71	not detected
NUS1	YDL193W	CTK2	P46962	323 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	DIA3	P52290	468 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	CTF4	Q01454	927 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	WAR1	Q03631	944 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	BUD7	Q08754	746 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	VMR1	P38735	1592 aa		4.34	□□□□□ -1.71
NUS1	YDL193W	SAC3	P46674	1301 aa		4.33	□□□□□ -1.72
NUS1	YDL193W	TPK2	P06245	380 aa		4.33	□□□□□ -1.72

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