RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W RPB8P20436 146 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W STV1P37296 890 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RFC1P38630 861 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YNG2P38806 282 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W BUR6P40096 142 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W DPH1P40487 425 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SIP4P46954 829 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CUL3P53202 744 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YTP1P53584 459 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YNL234WP53857 426 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YNL181WP53878 407 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CRZ1P53968 678 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ENT4Q07872 247 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W INP53Q12271 1107 aa3.4□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W TOP1P04786 769 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CBP1P07252 654 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W VMA16P23968 213 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CLB2P24869 491 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W LCB1P25045 558 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CHS3P29465 1165 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PDB1P32473 366 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W AGP2P38090 596 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YBR139WP38109 508 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W EFM2P38347 419 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W DIA4P38705 446 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RTS1P38903 757 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W DHH1P39517 506 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W FMP10P40098 244 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W INN1P53901 409 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ZDS2P54786 942 aa3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CTL1Q03220 320 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RIX7Q07844 837 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W HNM1P19807 563 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SNU114P36048 1008 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YBL029WP38201 376 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YEL068CP39977 110 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YJL070CP40361 888 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W DIA3P52290 468 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SGF73P53165 657 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RAD30Q04049 632 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ATG9Q12142 997 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ENT1Q12518 454 aa3.38□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W GFD2P25370 566 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ADH7P25377 361 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SEC1P30619 724 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RAD24P32641 659 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W MIA40P36046 403 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W MAL33P38157 468 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W LYS14P40971 790 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W VIP1Q06685 1146 aaKnown RBP3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W HUA2Q12134 243 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W NKP1Q12493 238 aa3.37□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W CDC16P09798 840 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YML002WP0CF17 737 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PWP1P21304 576 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W GAC1P28006 793 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RPN2P32565 945 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W AUR1P36107 401 aaPredicted RBP3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YPK3P38070 525 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W LEU5P38702 357 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W TMA108P40462 946 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ATG27P46989 271 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RPS7BP48164 190 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YSA1Q01976 231 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ATG26Q06321 1198 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YLR352WQ06479 807 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W LEU9Q12166 604 aaKnown RBP3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YBR126W-AQ8TGU7 68 aa3.36□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W MUD2P36084 527 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W DBP8P38719 431 aa3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W IAH1P41734 238 aa3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SGM1P47166 707 aa3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W STR3P53101 465 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W IMP4P53941 290 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W EMI2Q04409 500 aaKnown RBP3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YDL218WQ07629 317 aa3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YOL159CQ08300 171 aa3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W EDE1P34216 1381 aa3.35□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ARG81P05085 880 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RPL19AP0CX82 189 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RPL19BP0CX83 189 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PMS1P14242 873 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W MGR1P25573 417 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PAH1P32567 862 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PDR3P33200 976 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ELO1P39540 310 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W AFG3P39925 761 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W HXT9P40885 567 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W PTR3P43606 678 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W ROK1P45818 564 aaPredicted RBP3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YGR127WP53275 312 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SUB1P54000 292 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W BUD22Q04347 519 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W RSF1Q05043 376 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YDL121CQ07541 149 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W YDR056CQ12025 205 aa3.34□□□□□ -1.87
NSE4YDL105W SEC53P07283 254 aaKnown RBP3.33□□□□□ -1.88
NSE4YDL105W YCK1P23291 538 aa3.33□□□□□ -1.88
NSE4YDL105W PGS1P25578 521 aa3.33□□□□□ -1.88
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