RNA–Protein interactions for RNA: YPL212C

PUS1, Transcript of tRNA:pseudouridine synthase, yeast

Gene PUS1, Length 1,635 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUS1	YPL212C	BRF1	P29056	596 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MRP8	P35719	219 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MRPL7	P36519	292 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	FES1	P38260	290 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	PIK1	P39104	1066 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	AIM20	P40451	204 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MAF1	P41910	395 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SCS3	P53012	380 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YNL165W	P53891	406 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SIW14	P53965	281 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SLG1	P54867	378 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SRL4	Q03085	281 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	NHP10	Q03435	203 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	HSP31	Q04432	237 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	GRX8	Q05926	109 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	GGA1	Q06336	557 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SYT1	Q06836	1226 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ULA1	Q12059	462 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	NBP2	Q12163	236 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	PSY3	Q12318	242 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	HEM2	P05373	342 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SPE1	P08432	466 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MRPL33	P20084	86 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YIH1	P25637	258 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SEC66	P33754	206 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	DEF1	P35732	738 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MRP21	P38175	177 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YAP1801	P38856	637 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CYC2	P38909	366 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	RAD55	P38953	406 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YJR061W	P40355	935 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	AIF1	P52923	378 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	DSL1	P53847	754 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CDC14	Q00684	551 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	STP1	Q00947	519 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YDR109C	Q04585	715 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	PSR1	Q07800	427 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SGT1	Q08446	395 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SAS5	Q99314	248 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ATP6	P00854	259 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SNF4	P12904	322 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.09	□□□□□ -1.59	not detected
PUS1	YPL212C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	FAR1	P21268	830 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ADY2	P25613	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	AIM26	P32858	118 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SRP101	P32916	621 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	TKL2	P33315	681 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MDJ1	P35191	511 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	TDP1	P38319	544 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	BSD2	P38356	321 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SSN3	P39073	555 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	FAA2	P39518	744 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YIL089W	P40500	205 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CDC1	P40986	491 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YFL040W	P43562	540 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CNN1	P43618	361 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	GUF1	P46943	645 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	EFM6	P53970	246 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	RSC4	Q02206	625 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YPL062W	Q02781	134 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MUK1	Q02866	612 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	TRS31	Q03337	283 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YDR179W-A	Q03983	463 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	GLO2	Q05584	274 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ENT2	Q05785	613 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YCS4	Q06156	1176 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	CDA1	Q06702	301 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	YDL121C	Q07541	149 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	ESA1	Q08649	445 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	GPM2	Q12008	311 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	MDY2	Q12285	212 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	Q0182	Q9ZZW1	134 aa		5.09	□□□□□ -1.59
PUS1	YPL212C	TRP3	P00937	484 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUS1	YPL212C	GAL80	P04387	435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUS1	YPL212C	TPK1	P06244	397 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUS1	YPL212C	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	5.08	□□□□□ -1.6
PUS1	YPL212C	KSS1	P14681	368 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUS1	YPL212C	CCA1	P21269	546 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PUS1	YPL212C	SPB1	P25582	841 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6

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