RNA–Protein interactions for RNA: YPL157W

TGS1, Transcript of Trimethyl guanosine synthase, conserved nucleolar methyl transferase, yeast

Gene TGS1, Length 948 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TGS1	YPL157W	PMS1	P14242	873 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	BEM3	P32873	1128 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	BUD2	P33314	1104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PCL5	P38794	229 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TDA11	P38854	504 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PEX18	P38855	283 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	VPS8	P39702	1274 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	LRO1	P40345	661 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YIL166C	P40445	542 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	INA22	P40576	216 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	GSM1	P42950	618 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	HAM1	P47119	197 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	GTR1	Q00582	310 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FIN1	Q03898	291 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	DYN3	Q04949	312 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	DCS1	Q06151	350 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SFH1	Q06168	426 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ARR3	Q06598	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	OPY2	Q06810	360 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MDM36	Q06820	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	BRX1	Q08235	291 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ATP16	Q12165	160 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MSH5	Q12175	901 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MED4	Q12343	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RKR1	Q04781	1562 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	POL3	P15436	1097 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	HNM1	P19807	563 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RPO26	P20435	155 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	KIN3	P22209	435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SMI1	P32566	505 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YEL043W	P32618	956 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ATO2	P32907	282 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	VPS51	P36116	164 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	JNM1	P36224	373 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FES1	P38260	290 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	STN1	P38960	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PUG1	P40100	303 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	KHA1	P40309	873 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TEL2	P53038	688 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	VTI1	Q04338	217 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	CRD1	Q07560	283 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ENT1	Q12518	454 aa		4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PGK1	P00560	416 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PDE2	P06776	526 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PCK1	P10963	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	THR1	P17423	357 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	YCL049C	P25577	312 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	ADY2	P25613	283 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SSH4	P32343	579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	OCT1	P35999	772 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	PSY4	P38193	441 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	FCY21	P40039	528 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	RIC1	P40395	1056 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SNZ3	P43545	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	STB2	P46679	850 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	TRS85	P46944	698 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SNZ2	P53824	298 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	IZH3	Q07959	543 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	SSP2	Q08646	371 aa		4.91	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	GEA2	P39993	1459 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
TGS1	YPL157W	MSS116	P15424	664 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PMA2	P19657	947 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	VPS33	P20795	691 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	HSP30	P25619	332 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	NTH1	P32356	751 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	PXA2	P34230	853 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CCL1	P37366	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MNN2	P38069	597 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ATP3	P38077	311 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	CTP1	P38152	299 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	YBR138C	P38277	524 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	YJL193W	P39542	402 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ULP2	P40537	1034 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	POL31	P46957	487 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	NUP84	P52891	726 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	MUB1	Q03162	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RNH1	Q04740	348 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	RSA1	Q08932	381 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	ICL2	Q12031	575 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	BBP1	Q12365	385 aa		4.9	□□□□□ -1.63
TGS1	YPL157W	OCA6	Q12454	224 aa		4.9	□□□□□ -1.63

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