RNA–Protein interactions for RNA: YPL066W

RGL1, Transcript of Regulator of Rho1p signaling, cofactor of Tus1p, yeast

Gene RGL1, Length 1,440 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RGL1	YPL066W	ECM10	P39987	644 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	PSR2	Q07949	397 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	DAP1	Q12091	152 aa		3.06	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	PHO81	P17442	1178 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	SAN1	P22470	610 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	GRX7	P38068	203 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	YJR061W	P40355	935 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	PAP2	P53632	584 aa	Known RBP	3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	FCP1	Q03254	732 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	RSM28	Q03430	361 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	CSR2	Q12734	1121 aa		3.05	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	NCP1	P16603	691 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	CDC15	P27636	974 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	MIC60	P36112	540 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	RGI2	P40188	164 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	HXT9	P40885	567 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	AZF1	P41696	914 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	YTP1	P53584	459 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	SMA2	Q04658	369 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	YDL218W	Q07629	317 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	RSA1	Q08932	381 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	PPT2	Q12036	173 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	RRP6	Q12149	733 aa	Known RBP	3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.04	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	ATP4	P05626	244 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	GLN3	P18494	730 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	TOM20	P35180	183 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	PSF2	P40359	213 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	SWP82	P43554	623 aa		3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
RGL1	YPL066W	TPK1	P06244	397 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	CPR3	P25719	182 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	GAC1	P28006	793 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	SRB5	P32585	307 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	ESL2	P36168	1195 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	ERG7	P38604	731 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YJL068C	P40363	299 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	DIM1	P41819	318 aa	Known RBP	3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	FET5	P43561	622 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	NNF2	P53253	936 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	COX17	Q12287	69 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-C	P25383	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	BUD14	P27637	709 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YHL041W	P38730	149 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YFR020W	P43600	232 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	COG1	P53079	417 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	MAK10	Q02197	733 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TMA16	Q08687	178 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	NYV1	Q12255	253 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-B	Q12260	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		3.02	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	RAD16	P31244	790 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	MIA40	P36046	403 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.01	□□□□□ -1.93	not detected
RGL1	YPL066W	PHO90	P39535	881 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	3.01	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	SMC3	P47037	1230 aa		3.01	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	NUC1	P08466	329 aa		3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YCL049C	P25577	312 aa		3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	MDM31	P38880	579 aa		3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	PKP1	P40530	394 aa		3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	NUP100	Q02629	959 aa		3	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YIL060W	P40519	144 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	MRPL13	Q02204	264 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	2.99	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	APL4	Q12028	832 aa		2.99	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	MSM1	P22438	575 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YHR218W	P38899	603 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	RTS1	P38903	757 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	ACA1	P39970	489 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	CTF18	P49956	741 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YGL082W	P53155	381 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YEH2	Q07950	538 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YOL057W	Q08225	711 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	RDR1	Q08904	546 aa		2.98	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	SPE2	P21182	396 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	YKL050C	P35736	922 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	PHD1	P36093	366 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	GUF1	P46943	645 aa		2.97	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	2.97	□□□□□ -1.93
RGL1	YPL066W	ATG26	Q06321	1198 aa		2.97	□□□□□ -1.93

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