RNA–Protein interactions for RNA: YLR048W

RPS0B, Transcript of Protein component of the small (40S) ribosomal subunit, yeast

Gene RPS0B, Length 759 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPS0B	YLR048W	CLC1	P17891	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YSP3	P25036	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SEF1	P34228	1148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	LOT5	P34234	306 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	HES1	P35843	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SWH1	P35845	1188 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MAM1	P40065	302 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	NPA3	P47122	385 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MSY1	P48527	492 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	VTA1	Q06263	330 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	USV1	Q12132	391 aa		4.93	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	AAC1	P04710	309 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ADH7	P25377	361 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SEC66	P33754	206 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	UIP5	P36137	443 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YPT10	P38146	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FTH1	P38310	465 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RRF1	P38771	230 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	EFM4	P40516	257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	HXT14	P42833	540 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPS7B	P48164	190 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	BUL1	P48524	976 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	NMA2	P53204	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	KAP120	Q02932	1032 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YDR109C	Q04585	715 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ARG7	Q04728	441 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SOV1	Q04748	898 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TMA10	Q06177	86 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
RPS0B	YLR048W	CRT10	Q08226	957 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	TRM13	Q12383	476 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SEC39	Q12745	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CTF3	Q12748	733 aa		4.92	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	AMD2	P22580	549 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	BUD14	P27637	709 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.91	□□□□□ -1.62	not detected
RPS0B	YLR048W	SMI1	P32566	505 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MNN2	P38069	597 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YHR054C	P38780	354 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	MTG2	P38860	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	ALG5	P40350	334 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	LAS21	P40367	830 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	VMA13	P41807	478 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	INP52	P50942	1183 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	YNL092W	P53934	400 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	UBP16	Q02863	499 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RSM28	Q03430	361 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	FIN1	Q03898	291 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	VTI1	Q04338	217 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	REX3	Q12090	404 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RLM1	Q12224	676 aa		4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
RPS0B	YLR048W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	APN1	P22936	367 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	STE11	P23561	717 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LAC1	P28496	418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LIP5	P32875	414 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HEL1	P36113	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	DIA3	P52290	468 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	YGR111W	P53265	400 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HOT1	Q03213	719 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MMR1	Q06324	491 aa		4.9	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	STE4	P18851	423 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ERG4	P25340	473 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PRD1	P25375	712 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	LTV1	P34078	463 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	PIH1	P38768	344 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	UIP3	P39547	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MRX1	P40050	688 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MDE1	P47095	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	ECL1	P48235	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
RPS0B	YLR048W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63

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