RNA–Protein interactions for RNA: YKL033W

TTI1, Transcript of Subunit of the ASTRA complex, involved in chromatin remodeling, yeast

Gene TTI1, Length 3,117 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TTI1	YKL033W	APM4	Q99186	491 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SEC12	P11655	471 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CDC5	P32562	705 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NMD2	P38798	1089 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	VID27	P40157	782 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ENP2	P48234	707 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NGL1	Q08213	363 aa	Known RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SRL1	Q08673	210 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RTP1	Q12751	981 aa		1.44	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MSB2	P32334	1306 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	TUF1	P02992	437 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	DID4	P36108	232 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	HMT1	P38074	348 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RTS1	P38903	757 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MMF1	P40185	145 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MDR1	P53258	950 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YML119W	Q03208	357 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MYO5	Q04439	1219 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	PFA4	Q12006	378 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ATP12	P22135	325 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	DAL3	P32459	195 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	FPR3	P38911	411 aa	Known RBP	1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CIN1	P40987	1014 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	TAH18	Q12181	623 aa		1.43	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ADE4	P04046	510 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MAK32	P23060	363 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YCR043C	P25361	127 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	DRE2	P36152	348 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SCO2	P38072	301 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	WSC4	P38739	605 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	VPS8	P39702	1274 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	BOP3	P53958	396 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RIP1	P08067	215 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	AMD2	P22580	549 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	PDR3	P33200	976 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MED6	P38782	295 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YIL152W	P40455	235 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	COG2	P53271	262 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	UME1	Q03010	460 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YML053C	Q04978	212 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YLR455W	Q06188	304 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	FPR4	Q06205	392 aa	Predicted RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	PIG1	Q06216	648 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	DSE3	Q08729	430 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YNR061C	P53747	219 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NRT1	Q08485	598 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	1.42	□□□□□ -2.18	not detected
TTI1	YKL033W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		1.42	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NUC1	P08466	329 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CBP3	P21560	335 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	AEP2	P22136	580 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RIT1	P23796	513 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CSE2	P33308	149 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SDH8	P38345	138 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	GPG1	P53130	126 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	PEF1	P53238	335 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CUR1	Q06469	252 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	RAD34	Q06665	692 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	UBX3	Q12229	455 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	COQ1	P18900	473 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ADK2	P26364	225 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ERV46	P39727	415 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	TES1	P41903	349 aa	Known RBP	1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	NUP84	P52891	726 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YGL242C	P53066	181 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	FUS2	Q05670	677 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	LCB4	Q12246	624 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	YOR111W	Q99210	232 aa		1.41	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	SUI2	P20459	304 aa	Known RBP	1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ARG1	P22768	420 aa		1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	DPH2	P32461	534 aa		1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	COY1	P34237	679 aa		1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	CIR1	P42940	261 aa		1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	FMS1	P50264	508 aa		1.4	□□□□□ -2.18
TTI1	YKL033W	COS12	P53053	380 aa		1.4	□□□□□ -2.18

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 44.8 ms