RNA–Protein interactions for RNA: YDR069C

DOA4, Transcript of Ubiquitin hydrolase, yeast

Gene DOA4, Length 2,781 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DOA4	YDR069C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GPA1	P08539	472 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CKI1	P20485	582 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PEX6	P33760	1030 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YKL050C	P35736	922 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TPO5	P36029	618 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	HPM1	P40481	377 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AGX1	P43567	385 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NAS6	P50086	228 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RNH70	P53331	553 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MAP1	Q01662	387 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.19	□□□□□ -1.9	not detected
DOA4	YDR069C	SPO77	Q06134	477 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YAP7	Q08182	245 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ARP7	Q12406	477 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	JIP3	O13555	125 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	BI4	P03879	638 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DSF1	P0CX08	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YNR073C	P0CX09	502 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AEP2	P22136	580 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VMA16	P23968	213 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CYM1	P32898	989 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ERT1	P38140	529 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RSP5	P39940	809 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ALG5	P40350	334 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YIL077C	P40508	320 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	BUD6	P41697	788 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TDA10	P42938	290 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	FMP32	P43557	207 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NCS6	P53088	359 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ZPR1	P53303	486 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	TOF1	P53840	1238 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PET117	Q02771	107 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	THI22	Q06490	572 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YPR196W	Q06595	470 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DDC1	Q08949	612 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	OSW2	Q12202	724 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NTO1	Q12311	748 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NCA2	Q12374	616 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SPO14	P36126	1683 aa		3.19	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MTF2	P10849	440 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NIC96	P34077	839 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DUG2	P38149	878 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AIM2	P39721	246 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	AVT6	P40074	448 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	EFM4	P40516	257 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	UFE1	P41834	346 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GYP8	P43570	497 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PFD1	P46988	109 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YGR153W	P48238	217 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MSE1	P48525	536 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YNL146W	P53906	100 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ORC3	P54790	616 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.18	□□□□□ -1.9	not detected
DOA4	YDR069C	YDR239C	Q03780	787 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CTI6	Q08923	506 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RCN2	Q12044	265 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	REX3	Q12090	404 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	MED2	Q12124	431 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YOR214C	Q12282	236 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ATG11	Q12527	1178 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CMC2	Q3E7A4	109 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LAG2	Q92325	660 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YOS9	Q99220	542 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	DFG16	Q99234	619 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	BUD3	P25558	1636 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	NUP192	P47054	1683 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CHS1	P08004	1131 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	PRD1	P25375	712 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ADY2	P25613	283 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CHS3	P29465	1165 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ACH1	P32316	526 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SRB4	P32569	687 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	SDS22	P36047	338 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YBR284W	P38150	797 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GOS1	P38736	223 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YER184C	P39961	794 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	YTA12	P40341	825 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	GTT1	P40582	234 aa		3.18	□□□□□ -1.9
DOA4	YDR069C	CCC1	P47818	322 aa		3.18	□□□□□ -1.9

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