RNA–Protein interactions for RNA: YBR257W

POP4, Transcript of Subunit of both RNase MRP and nuclear RNase P, yeast

Gene POP4, Length 840 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POP4	YBR257W	GUD1	Q07729	489 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	FAP7	Q12055	197 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SNU66	Q12420	587 aa	Predicted RBP	4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ZPS1	Q12512	249 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	POM152	P39685	1337 aa		4.67	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RIF1	P29539	1916 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SNA3	P14359	133 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PRE4	P30657	266 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SIN4	P32259	974 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SMY1	P32364	656 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	NMD5	P46970	1048 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	IRC8	P47046	822 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RPC17	P47076	161 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	SGM1	P47166	707 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	YGR153W	P48238	217 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	KAP114	P53067	1004 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	RTC4	P53850	401 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	ASI1	P54074	624 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	GIR2	Q03768	265 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	PRP42	Q03776	544 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	KRE28	Q04431	385 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	TIP41	Q12199	356 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	CEX1	Q12453	761 aa		4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	FIG2	P25653	1609 aa		4.65	□□□□□ -1.66
POP4	YBR257W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	NUC1	P08466	329 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CBF2	P32504	956 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	BEM3	P32873	1128 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YKR075C	P36155	307 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YBR032W	P38223	100 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	EXO84	P38261	753 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RIM4	P38741	713 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FTR1	P40088	404 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MGS1	P40151	587 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	THI6	P41835	540 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YRB1	P41920	201 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	BST1	P43571	1029 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	VTC2	P43585	828 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YGL138C	P53122	345 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ORM1	P53224	222 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YGR054W	P53235	642 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ATP23	P53722	227 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FOL1	P53848	824 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FDC1	Q03034	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YDR341C	Q05506	607 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	IMH1	Q06704	911 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
POP4	YBR257W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SEY1	Q99287	776 aa		4.65	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CLN3	P13365	580 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	OM45	P16547	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SPS22	P25380	463 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPC53	P25441	422 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CNE1	P27825	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PLC1	P32383	869 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	NIP100	P33420	868 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YBL055C	P34220	418 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MMS21	P38632	267 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	VID30	P53076	958 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	GPG1	P53130	126 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YGR021W	P53212	290 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TOF1	P53840	1238 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	GTB1	Q04924	702 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	NFI1	Q12216	726 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RRI2	Q12348	645 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	TMA17	Q12513	150 aa		4.64	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	FOB1	O13329	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PEP5	P12868	1029 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	POL3	P15436	1097 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	VPH2	P32341	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SSE1	P32589	693 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	NPL6	P32832	435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MYO3	P36006	1272 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	HSM3	P38348	480 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RFC3	P38629	340 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	PPE1	P38796	400 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	RRP8	P38961	392 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	ALG5	P40350	334 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	JEM1	P40358	645 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	CSM2	P40465	213 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	SEC27	P41811	889 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	MEP2	P41948	499 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	STB1	P42845	420 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	BUD17	P53727	317 aa		4.63	□□□□□ -1.67
POP4	YBR257W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67

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