RNA–Protein interactions for RNA: YOR014W

RTS1, Transcript of B-type regulatory subunit of protein phosphatase 2A (PP2A), yeast

Gene RTS1, Length 2,274 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTS1	YOR014W	HEL2	Q05580	639 aa	Known RBP	4.13	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	GGA1	Q06336	557 aa		4.13	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	MRN1	Q08925	612 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.13	□□□□□ -1.75	not detected
RTS1	YOR014W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ABF1	P14164	731 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	STE4	P18851	423 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ERG4	P25340	473 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	SAS3	P34218	831 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	TOD6	P34219	525 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	SWP82	P43554	623 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	UFO1	Q04511	668 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	BUD7	Q08754	746 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	NFI1	Q12216	726 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	DFR1	P07807	211 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.12	□□□□□ -1.75	not detected
RTS1	YOR014W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	APE1	P14904	514 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	GCS1	P35197	352 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	UBP11	P36026	717 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	KSP1	P38691	1029 aa	Known RBP	4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	NPA3	P47122	385 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	RIM20	Q12033	661 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.12	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	STB6	P36085	766 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	APL3	P38065	1025 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CST26	P38226	397 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	RXT2	P38255	430 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	LNP1	P38878	278 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YDR286C	Q05530	114 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CRN1	Q06440	651 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	COX1	P00401	534 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	OMA1	P36163	345 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	VID24	P38263	362 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ERC1	P38767	581 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	DOT5	P40553	215 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	MSY1	P48527	492 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YGR066C	P53242	292 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	RIA1	P53893	1110 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	RPC11	Q04307	110 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ISN1	Q99312	450 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.11	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ALG7	P07286	448 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PRP6	P19735	899 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	STE50	P25344	346 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	HES1	P35843	434 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	DSN1	P40568	576 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CTK2	P46962	323 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	SMC3	P47037	1230 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	BNI5	P53890	448 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	VPS9	P54787	451 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YAT1	P80235	687 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	UBP16	Q02863	499 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	AIM32	Q04689	311 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	MRD1	Q06106	887 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	BAG7	Q12128	409 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	AAC1	P04710	309 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	STE12	P13574	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CLN1	P20437	546 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	MNN2	P38069	597 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YNG2	P38806	282 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	THI6	P41835	540 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	MSE1	P48525	536 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ATG4	P53867	494 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CIK1	Q01649	594 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	TRS23	Q03784	219 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CDC45	Q08032	650 aa		4.1	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	LAM4	P38800	1345 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PCT1	P13259	424 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	MNE1	P24720	663 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YIH1	P25637	258 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CDC15	P27636	974 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PHO23	P50947	330 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	RNT1	Q02555	471 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	ERV41	Q04651	352 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	SWA2	Q06677	668 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	YLR040C	Q07988	224 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PGC1	Q08959	321 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	BMS1	Q08965	1183 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	TGS1	Q12052	315 aa		4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
RTS1	YOR014W	CLB1	P24868	471 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	CLB3	P24870	427 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	LOT5	P34234	306 aa		4.09	□□□□□ -1.76
RTS1	YOR014W	PES4	P39684	611 aa		4.09	□□□□□ -1.76

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