RNA–Protein interactions for RNA: YMR017W

SPO20, Transcript of Meiosis-specific subunit of the t-SNARE complex, yeast

Gene SPO20, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO20	YMR017W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	CDC15	P27636	974 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	MCM10	P32354	571 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	MRX1	P40050	688 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	FMP10	P40098	244 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	MCH4	Q08268	501 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	NBP2	Q12163	236 aa		4.83	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	GPA1	P08539	472 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	VID27	P40157	782 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	CFD1	P40558	293 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	RSM28	Q03430	361 aa		4.82	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	PET111	P08468	800 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	CNA1	P23287	553 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YCR006C	P25350	157 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	ALY1	P36117	915 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	ECM10	P39987	644 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YLR455W	Q06188	304 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	RRI1	Q12468	440 aa		4.81	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	JHD1	P40034	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YJR061W	P40355	935 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	MNT3	P40549	630 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	IME4	P41833	600 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	CTK2	P46962	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	PFA5	Q03289	374 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	PIG1	Q06216	648 aa		4.8	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	PXL1	P36166	706 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	FLO5	P38894	1075 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SLZ1	P40167	298 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YNL144C	P53907	740 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	VTC3	Q02725	835 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	MUB1	Q03162	620 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	AFT2	Q08957	416 aa		4.79	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	CHO1	P08456	276 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YFR020W	P43600	232 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SIP4	P46954	829 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	AAD10	P47182	288 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	BSC5	P53755	489 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YDL121C	Q07541	149 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	ENT4	Q07872	247 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	SKM1	Q12469	655 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	NKP1	Q12493	238 aa		4.78	□□□□□ -1.64
SPO20	YMR017W	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	ESL2	P36168	1195 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	VPS41	P38959	992 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	UBP8	P50102	471 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	SWF1	Q04629	336 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	BUD21	Q08492	214 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	FRE3	Q08905	711 aa		4.77	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	RAP1	P11938	827 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	STE50	P25344	346 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	CHS3	P29465	1165 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	SCO2	P38072	301 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YEL068C	P39977	110 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YPT11	P48559	417 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	INN1	P53901	409 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	RIX7	Q07844	837 aa	Known RBP	4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	HER1	Q12276	1246 aa		4.76	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	RPL15B	P54780	204 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	RAD30	Q04049	632 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YOR111W	Q99210	232 aa		4.75	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YPR089W	O13585	888 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	PCI8	P40512	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	PKP1	P40530	394 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	LYS14	P40971	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	ASI1	P54074	624 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	YSA1	Q01976	231 aa		4.74	□□□□□ -1.65
SPO20	YMR017W	INA17	Q02888	182 aa		4.74	□□□□□ -1.65

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