RNA–Protein interactions for RNA: YLL055W

YCT1, Transcript of High-affinity cysteine-specific transporter, yeast

Gene YCT1, Length 1,596 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCT1	YLL055W	LHS1	P36016	881 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PSY4	P38193	441 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	UME6	P39001	836 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	MRX1	P40050	688 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	IRC8	P47046	822 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SWF1	Q04629	336 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YLR455W	Q06188	304 aa		3.4	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.4	□□□□□ -1.87	RIP-Chip
YCT1	YLL055W	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	TOP1	P04786	769 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SRB5	P32585	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	VPS25	P47142	202 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YGR021W	P53212	290 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	GTR1	Q00582	310 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	FCP1	Q03254	732 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	FRE3	Q08905	711 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	UBX3	Q12229	455 aa		3.39	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PXL1	P36166	706 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SWP82	P43554	623 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	BNA1	P47096	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	REG1	Q00816	1014 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	GSH2	Q08220	491 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	TRM8	Q12009	286 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PET111	P08468	800 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	CDC15	P27636	974 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ATO2	P32907	282 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	CNS1	P33313	385 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	FUI1	P38196	639 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RIC1	P40395	1056 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	BOP3	P53958	396 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PFA5	Q03289	374 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RSM28	Q03430	361 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	CAC2	Q04199	468 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	VID22	Q05934	901 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	VCX1	Q99385	411 aa		3.38	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YLR302C	O13544	120 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ERG8	P24521	451 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SLC1	P33333	303 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ECM10	P39987	644 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	CTK2	P46962	323 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	IML2	P47031	731 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	VPS4	P52917	437 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	POS5	Q06892	414 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SNA4	Q07549	140 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	NUS1	Q12063	375 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YLR112W	Q12130	139 aa		3.37	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	CHO1	P08456	276 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	STE50	P25344	346 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PSD1	P39006	500 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	DSE3	Q08729	430 aa		3.36	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	TKL1	P23254	680 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YIL152W	P40455	235 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ASI1	P54074	624 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SRL1	Q08673	210 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YOR019W	Q99248	730 aa		3.35	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	RAP1	P11938	827 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YER010C	P40011	234 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	YNR061C	P53747	219 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	IZH1	Q03419	316 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ECI1	Q05871	280 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	MLH2	Q07980	695 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	PSK2	Q08217	1101 aa		3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
YCT1	YLL055W	ESL2	P36168	1195 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	PCL6	P40038	420 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	VRG4	P40107	337 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	IME4	P41833	600 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YFR020W	P43600	232 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YML131W	Q03102	365 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	NUP53	Q03790	475 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	RCO1	Q04779	684 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	BUD7	Q08754	746 aa		3.34	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	TRX2	P22803	104 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MRP20	P32387	263 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	RRN3	P36070	627 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	MNN2	P38069	597 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	AXL2	P38928	823 aa		3.33	□□□□□ -1.88
YCT1	YLL055W	SNO4	Q04902	237 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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