RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	PHO11	P35842	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	PHO12	P38693	467 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	PCL5	P38794	229 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	FET5	P43561	622 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	EMI1	Q04406	187 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ADY3	Q07732	790 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RKM5	Q12367	367 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	YPR089W	O13585	888 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	SPO16	P17122	198 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	IML3	P38265	245 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CYC2	P38909	366 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CCT6	P39079	546 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ELO1	P39540	310 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	PXA1	P41909	870 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	TAH11	P47112	604 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	BNA5	Q05979	453 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	BUD7	Q08754	746 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ACM1	Q08981	209 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	VPS68	Q12016	184 aa		5.74	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	BRR2	P32639	2163 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	SEM1	O94742	89 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	SPR1	P32603	445 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	UBC6	P33296	250 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	LDB7	P38210	180 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	REI1	P38344	393 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	TIM17	P39515	158 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ALG8	P40351	577 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	VTI1	Q04338	217 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RCO1	Q04779	684 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	YLR456W	Q06199	204 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ALR1	Q08269	859 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	NUM1	Q00402	2748 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CUP1-1	P0CX80	61 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CUP1-2	P0CX81	61 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	SRP101	P32916	621 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	PRP18	P33411	251 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	MRP21	P38175	177 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	DBP8	P38719	431 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	NMD5	P46970	1048 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	BIR1	P47134	954 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	PET117	Q02771	107 aa		5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	BUD20	Q08004	166 aa	Predicted RBP	5.73	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	INO1	P11986	533 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	HSP60	P19882	572 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	SMI1	P32566	505 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	STB6	P36085	766 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	GMH1	P36125	273 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	IME4	P41833	600 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	VTA1	Q06263	330 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	GCR1	P07261	785 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RDS2	P19541	446 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	VAN1	P23642	535 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	URA10	P30402	227 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	MRPL9	P31334	269 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	BYE1	P36106	594 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	ACO2	P39533	789 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	NUP85	P46673	744 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	RPL22B	P56628	122 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	OSH6	Q02201	448 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CCE1	Q03702	353 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	NHX1	Q04121	633 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	PLB3	Q08108	686 aa		5.72	□□□□□ -1.49
PUF3	YLL013C	CMD1	P06787	147 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	TRM1	P15565	570 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	URA7	P28274	579 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	BEM1	P29366	551 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NAM8	Q00539	523 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CSF1	Q12150	2958 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	CDC20	P26309	610 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YEL043W	P32618	956 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SEO1	P39709	593 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	GTS1	P40956	396 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YFL012W	P43580	148 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	ARH1	P48360	493 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PEX8	P53248	589 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	COG6	P53959	839 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	YDR109C	Q04585	715 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	NUT2	Q06213	157 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SLD7	Q08457	257 aa		5.71	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	SPS1	P08458	490 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PPH21	P23594	369 aa		5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
PUF3	YLL013C	MSH1	P25846	959 aa		5.7	□□□□□ -1.5

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