RNA–Protein interactions for RNA: YJL004C

SYS1, Transcript of Integral membrane protein of the Golgi, yeast

Gene SYS1, Length 612 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SYS1	YJL004C	YJR120W	P47157	116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YLR049C	Q12110	428 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	NUP159	P40477	1460 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YBT1	P32386	1661 aa		3.38	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YML002W	P0CF17	737 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PRP16	P15938	1071 aa	Predicted RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	DJP1	P40564	432 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	MSY1	P48527	492 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YLR455W	Q06188	304 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ARP7	Q12406	477 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PDR5	P33302	1511 aa	Known RBP	3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ATG2	P53855	1592 aa		3.37	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PMS1	P14242	873 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	OPY1	P38271	328 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	CAB2	P40506	365 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ROK1	P45818	564 aa	Predicted RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ATG27	P46989	271 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YNL234W	P53857	426 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	IMP4	P53941	290 aa	Known RBP	3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	FCP1	Q03254	732 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YLR352W	Q06479	807 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ICL2	Q12031	575 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	MMS1	Q06211	1407 aa		3.36	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	DNF1	P32660	1571 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	URK1	P27515	501 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	FRD1	P32614	470 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	PAF1	P38351	445 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ATG21	Q02887	496 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	MCP2	Q06567	569 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	ATG23	Q06671	453 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TSC11	P40061	1430 aa		3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-C	P25384	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-DR2	Q03494	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY1B-DR1	Q03855	1755 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-DR3	Q07791	1770 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-OR1	Q12113	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-DR1	Q12472	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	TY2B-OR2	Q12501	1770 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	MGR1	P25573	417 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	GRX4	P32642	244 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YPK3	P38070	525 aa		3.34	□□□□□ -1.87
SYS1	YJL004C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	CYB2	P00175	591 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	GCD7	P32502	381 aa	Predicted RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	LEU5	P38702	357 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	YFR016C	P43597	1233 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	RSF1	Q05043	376 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	TY2B-B	Q12491	1770 aa		3.33	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	PET122	P10355	254 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	PCT1	P13259	424 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	SIR1	P21691	654 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	STE50	P25344	346 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	TRS65	P32893	560 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	STT3	P39007	718 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	BUD16	P39988	312 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	IAH1	P41734	238 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	ARP10	Q04549	284 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	SMA2	Q04658	369 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	MHP1	P43638	1398 aa		3.32	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	QCR6	P00127	147 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	BAR1	P12630	587 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	MCM3	P24279	971 aa	Known RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	MRC1	P25588	1096 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	MSH1	P25846	959 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	MAD3	P47074	515 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	ASI1	P54074	624 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	YDR415C	Q04033	374 aa	Predicted RBP	3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.31	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	RPO31	P04051	1460 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	CPR3	P25719	182 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	PDR3	P33200	976 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	RIM2	P38127	377 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	YJR061W	P40355	935 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	DAP1	Q12091	152 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	DNF2	Q12675	1612 aa		3.3	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	VPS15	P22219	1454 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	EDE1	P34216	1381 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	PGI1	P12709	554 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	DED81	P38707	554 aa	Known RBP	3.29	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	YIR014W	P40570	242 aa		3.29	□□□□□ -1.88
SYS1	YJL004C	TAM41	P53230	385 aa		3.29	□□□□□ -1.88

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 26.8 ms