RNA–Protein interactions for RNA: YHR185C

PFS1, Transcript of Sporulation protein required for prospore membrane formation, yeast

Gene PFS1, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PFS1	YHR185C	IRC7	P43623	340 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	FCP1	Q03254	732 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	NBP2	Q12163	236 aa		4.12	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	ILS1	P09436	1072 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	CHS3	P29465	1165 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	JHD1	P40034	492 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	FMP10	P40098	244 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YJR061W	P40355	935 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YIL024C	P40543	189 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	MNT3	P40549	630 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	CDC1	P40986	491 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SIP4	P46954	829 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	ORC5	P50874	479 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SCS3	P53012	380 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SCW4	P53334	386 aa	Known RBP	4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YDR056C	Q12025	205 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YOR019W	Q99248	730 aa		4.11	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YUR1	P26725	428 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	CDC15	P27636	974 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	MSS51	P32335	436 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	LHS1	P36016	881 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	UBP13	P38187	747 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	FLO5	P38894	1075 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	MRX1	P40050	688 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	IME4	P41833	600 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	MUB1	Q03162	620 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	TDA9	Q04545	1251 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	HER1	Q12276	1246 aa		4.1	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YER190C-B	P0CX94	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YEL077W-A	P0CX95	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YGR296C-B	P0CX96	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YPL283W-B	P0CX97	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YPR204C-A	P0CX98	160 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	ALY1	P36117	915 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	YEL068C	P39977	110 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SLZ1	P40167	298 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	PCI8	P40512	444 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	PIL1	P53252	339 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	BSC5	P53755	489 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	RSM28	Q03430	361 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	VIP1	Q06685	1146 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	GPN2	Q08726	347 aa	Predicted RBP	4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	SKM1	Q12469	655 aa		4.09	□□□□□ -1.75
PFS1	YHR185C	GAL4	P04386	881 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	KTR3	P38130	404 aa	Predicted RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ARN1	P38731	627 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YJL107C	P42947	387 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	IRC8	P47046	822 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	INN1	P53901	409 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	PDR8	Q06149	701 aa		4.08	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YPR089W	O13585	888 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YBR085C-A	O43137	85 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	PET111	P08468	800 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	CDC16	P09798	840 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YCR006C	P25350	157 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	COQ3	P27680	312 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ASK1	P35734	292 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	OCT1	P35999	772 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.07	□□□□□ -1.76	not detected
PFS1	YHR185C	TMA108	P40462	946 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	AAD10	P47182	288 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ENT4	Q07872	247 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	PFA4	Q12006	378 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ENT1	Q12518	454 aa		4.07	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ESL2	P36168	1195 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	ECM10	P39987	644 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	LYS14	P40971	790 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	CTK2	P46962	323 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	VPS72	Q03388	795 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	MCH4	Q08268	501 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.06	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	CHO1	P08456	276 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	RPL19A	P0CX82	189 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	RPL19B	P0CX83	189 aa	Predicted RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	SAN1	P22470	610 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	PRE8	P23639	250 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	PAH1	P32567	862 aa		4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.05	□□□□□ -1.76
PFS1	YHR185C	CFD1	P40558	293 aa		4.05	□□□□□ -1.76

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