RNA–Protein interactions for RNA: YFL039C

ACT1, Transcript of Actin, yeast

Gene ACT1, Length 1,128 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACT1	YFL039C	JJJ1	P53863	590 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TEP1	P53916	434 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ARP5	P53946	755 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YML119W	Q03208	357 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RBA50	Q04418	439 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ARO10	Q06408	635 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	HIM1	Q06674	414 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YLL032C	Q07834	825 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
ACT1	YFL039C	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PSF3	Q12146	194 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MDM20	Q12387	796 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ARP7	Q12406	477 aa		4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MIS1	P09440	975 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CDC16	P09798	840 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	KSS1	P14681	368 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	GRR1	P24814	1151 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CNE1	P27825	502 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MRP4	P32902	394 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PPZ2	P33329	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	KDX1	P36005	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YBR225W	P38321	900 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RTS1	P38903	757 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ALD5	P40047	520 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SHE4	P51534	789 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RPN14	P53196	417 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	LSB1	P53281	241 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	REX2	P54964	269 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MFM1	Q02783	413 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	USA1	Q03714	838 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	GIS1	Q03833	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RRB1	Q04225	511 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MFB1	Q04922	465 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	KEL3	Q08979	651 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	DIN7	Q12086	430 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	APC2	Q12440	853 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		4.93	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	LEU2	P04173	364 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PUT4	P15380	627 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ARG1	P22768	420 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ROX1	P25042	368 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	STE50	P25344	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.92	□□□□□ -1.62	not detected
ACT1	YFL039C	GPI10	P30777	616 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	FLO10	P36170	1169 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	PIH1	P38768	344 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	ATF1	P40353	525 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YIL092W	P40497	633 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	INA22	P40576	216 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YGL117W	P53133	265 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YGR266W	P53326	701 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CPR8	P53728	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YNR071C	P53757	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	TRS23	Q03784	219 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YPL216W	Q08964	1102 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	GLE1	Q12315	538 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	FRE6	Q12473	712 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SEC39	Q12745	709 aa		4.92	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MTF2	P10849	440 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	STE12	P13574	688 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	VPS3	P23643	1011 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SGF29	P25554	259 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MGM1	P32266	881 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	LCB2	P40970	561 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	SAP4	P53036	818 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	BUD17	P53727	317 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CBK1	P53894	756 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YPL107W	Q02873	248 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	MDY2	Q12285	212 aa		4.91	□□□□□ -1.62
ACT1	YFL039C	URA3	P03962	267 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	SEC12	P11655	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	OLE1	P21147	510 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PHO3	P24031	467 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YCL049C	P25577	312 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	HSP104	P31539	908 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	DSS4	P32601	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	GYP6	P32806	458 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACT1	YFL039C	UGP1	P32861	499 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63

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