RNA–Protein interactions for RNA: YCL057W

PRD1, Transcript of Zinc metalloendopeptidase, yeast

Gene PRD1, Length 2,139 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PRD1	YCL057W	ZPS1	Q12512	249 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PRD1	YCL057W	IFA38	P38286	347 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PSF2	P40359	213 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SPO22	P40511	975 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YPT11	P48559	417 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YGL242C	P53066	181 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MLC1	P53141	149 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	COQ6	P53318	479 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CRF1	Q04930	467 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YDL121C	Q07541	149 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	NKP1	Q12493	238 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	WHI2	P12611	486 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MUP3	P38734	546 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	FAF1	P40546	346 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	IML2	P47031	731 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CPR8	P53728	308 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RBA50	Q04418	439 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	ALE1	Q08548	619 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SWI1	P09547	1314 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	LPD1	P09624	499 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SSH4	P32343	579 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	TMA16	Q08687	178 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SUT2	Q12286	268 aa		5.01	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	TPK2	P06245	380 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	ASN1	P49089	572 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PSK2	Q08217	1101 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PET122	P10355	254 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MCM4	P30665	933 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	VPS8	P39702	1274 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	BUD16	P39988	312 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SEC9	P40357	651 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	TAM41	P53230	385 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	VAM6	Q07468	1049 aa		5	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	AMD2	P22580	549 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RRN3	P36070	627 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MRPL36	P36531	177 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	VID27	P40157	782 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	TFG2	P41896	400 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	EPL1	P43572	832 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	VPS75	P53853	264 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	VID22	Q05934	901 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CRT10	Q08226	957 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	TRM8	Q12009	286 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CHO2	P05374	869 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PMA2	P19657	947 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	IMP2'	P32351	346 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	TDP1	P38319	544 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CAJ1	P39101	391 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CAF130	P53280	1122 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	GIS1	Q03833	894 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	ARG7	Q04728	441 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	URK1	P27515	501 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	GEX2	P36173	615 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YEL020C	P39994	560 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RPN13	O13563	156 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	HSP82	P02829	709 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	STE12	P13574	688 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MRK1	P50873	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YML119W	Q03208	357 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PRP3	Q03338	469 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	GFD1	Q04839	188 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SFH1	Q06168	426 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	OPY2	Q06810	360 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PCL8	Q08966	492 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	SWH1	P35845	1188 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	CCT4	P39078	528 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	MAK10	Q02197	733 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	ATG23	Q06671	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	LCB4	Q12246	624 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PCD1	Q12524	340 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRD1	YCL057W	PHO13	P19881	312 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	PDE1	P22434	369 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PRD1	YCL057W	PEP3	P27801	918 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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