RNA–Protein interactions for RNA: YOR242C

SSP2, Transcript of Sporulation specific protein that localizes to the spore wall, yeast

Gene SSP2, Length 1,116 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SSP2	YOR242C	SCO2	P38072	301 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	PDR8	Q06149	701 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	PCD1	Q12524	340 aa		4.99	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	PCT1	P13259	424 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	CNA1	P23287	553 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YSP3	P25036	478 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YCL049C	P25577	312 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	EXO84	P38261	753 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	SPC97	P38863	823 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	DJP1	P40564	432 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YNL144C	P53907	740 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YPL068C	Q02749	293 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	SWT1	Q12104	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	COX17	Q12287	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	NUC1	P08466	329 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	TPM2	P40414	161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	YPT11	P48559	417 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	BLS1	Q06071	122 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	ATG23	Q06671	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	BAG7	Q12128	409 aa		4.97	□□□□□ -1.61
SSP2	YOR242C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
SSP2	YOR242C	YCR006C	P25350	157 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MGM1	P32266	881 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	DBF20	P32328	564 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	NUP120	P35729	1037 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	OCT1	P35999	772 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	IFA38	P38286	347 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	YIR016W	P40572	265 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	COG1	P53079	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	YGL036W	P53185	909 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MRPL13	Q02204	264 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	SWA2	Q06677	668 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MCH4	Q08268	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	YER145C-A	A0A023PYF4	145 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	GEX2	P36173	615 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MRPL36	P36531	177 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	IRC8	P47046	822 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	VTC3	Q02725	835 aa		4.95	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TPK1	P06244	397 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	GPA1	P08539	472 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	ADE17	P38009	592 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	ASG1	P40467	964 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MDV1	P47025	714 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	ATX2	Q12067	313 aa		4.94	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-C	P25383	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	UBP13	P38187	747 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	NPR3	P38742	1146 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	VPS41	P38959	992 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	PHM8	P40025	321 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	PIG1	Q06216	648 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.93	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	MTF2	P10849	440 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	SPO16	P17122	198 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	UBC1	P21734	215 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	SMK1	P41808	388 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	CRN1	Q06440	651 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	TMA16	Q08687	178 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	FRE3	Q08905	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	RAD16	P31244	790 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	ATO2	P32907	282 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	SNA4	Q07549	140 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.91	□□□□□ -1.62
SSP2	YOR242C	PXL1	P36166	706 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	VPS25	P47142	202 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	UBP8	P50102	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	ASE1	P50275	885 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	EAF7	P53911	425 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	YLR455W	Q06188	304 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	TFC6	Q06339	672 aa		4.9	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PET111	P08468	800 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SRP54	P20424	541 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PTH2	P34222	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	SAP185	P40856	1058 aa		4.89	□□□□□ -1.63
SSP2	YOR242C	PFA5	Q03289	374 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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