RNA–Protein interactions for RNA: YOL077C

BRX1, Transcript of Nucleolar protein, yeastyeast

Gene BRX1, Length 876 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BRX1YOL077C MSY1P48527 492 aa3.69□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YPR003CP53394 754 aa3.69□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C MRPL13Q02204 264 aa3.69□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C VTC3Q02725 835 aa3.69□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C ECM22Q05958 814 aaPredicted RBP3.69□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C GAL4P04386 881 aa3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C APA1P16550 321 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C NCP1P16603 691 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C RAD16P31244 790 aa3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C MGM1P32266 881 aa3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C TOM71P38825 639 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C TPM2P40414 161 aa3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YIR016WP40572 265 aa3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C DCP2P53550 970 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C ADE16P54113 591 aaKnown RBP3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C PDR8Q06149 701 aa3.68□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C TPK1P06244 397 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C MRP2P10663 115 aaPredicted RBP3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C CNA1P23287 553 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YCR006CP25350 157 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C OCT1P35999 772 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YPT11P48559 417 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C UBP8P50102 471 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C ARC35P53731 342 aaKnown RBP3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C IOC4Q04213 475 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C SWA2Q06677 668 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C VAM6Q07468 1049 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C MCH4Q08268 501 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YLR049CQ12110 428 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C COX17Q12287 69 aa3.67□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YML003WP0CF16 290 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YER190C-BP0CX94 160 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YEL077W-AP0CX95 160 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YGR296C-BP0CX96 160 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YPL283W-BP0CX97 160 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YPR204C-AP0CX98 160 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C PHM8P40025 321 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C SMK1P41808 388 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C ASE1P50275 885 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C COG1P53079 417 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C YPL068CQ02749 293 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C ATX2Q12067 313 aa3.66□□□□□ -1.82
BRX1YOL077C PFK2P16862 959 aaKnown RBP RIP-Chip data3.65□□□□□ -1.83not detected
BRX1YOL077C AIM17P23180 465 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C DBF20P32328 564 aa3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C MRS6P32864 603 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C CDC1P40986 491 aa3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C MDV1P47025 714 aa3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C VPS25P47142 202 aa3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C RPL15BP54780 204 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C VMS1Q04311 632 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C CSR1Q06705 408 aaKnown RBP3.65□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C MTF2P10849 440 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C PCT1P13259 424 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C UBC1P21734 215 aaKnown RBP3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C XRS2P33301 854 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C LHS1P36016 881 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C EXO84P38261 753 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C UME6P39001 836 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C IST3P40565 148 aaPredicted RBP3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C SAP185P40856 1058 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C IRC8P47046 822 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C CIA1Q05583 330 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C CRN1Q06440 651 aa3.64□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C PUF2Q12221 1075 aaKnown RBP RIP-Chip data3.64□□□□□ -1.83not detected
BRX1YOL077C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-FP0CX61 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-GR2P0CX62 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C YSP3P25036 478 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C YCP4P25349 247 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-CP25383 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TEF4P36008 412 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C IFA38P38286 347 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C MRX1P40050 688 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C BOP3P53958 396 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C FCP1Q03254 732 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-DR2Q03483 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C SWF1Q04629 336 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C PIG1Q06216 648 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TMA16Q08687 178 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-BQ12260 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-OR2Q12293 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-DR1Q12392 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-OR1Q12439 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C ERG27Q12452 347 aaKnown RBP3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TY2A-DR3Q99303 438 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C SSM4P40318 1319 aa3.63□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C GPA1P08539 472 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C CDC15P27636 974 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C SOF1P33750 489 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C TFC3P34111 1160 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C ADE17P38009 592 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C UBP13P38187 747 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C CSL4P53859 292 aaPredicted RBP3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C PFA5Q03289 374 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C ATG16Q03818 150 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C GSH2Q08220 491 aa3.62□□□□□ -1.83
BRX1YOL077C DSE3Q08729 430 aa3.62□□□□□ -1.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 18.1 ms