RNA–Protein interactions for RNA: YLR308W

CDA2, Transcript of Chitin deacetylase, yeast

Gene CDA2, Length 939 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CDA2	YLR308W	ECM32	P32644	1121 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	TFC3	P34111	1160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	CIR1	P42940	261 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	UBX6	P47049	396 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	PLM2	Q04383	521 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	SWT1	Q12104	458 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	BAG7	Q12128	409 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	COX17	Q12287	69 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	PRE8	P23639	250 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	LRE1	P25579	583 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	MCM10	P32354	571 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	IFA38	P38286	347 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	UBP7	P40453	1071 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	CBK1	P53894	756 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	RCO1	Q04779	684 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CDA2	YLR308W	HSC82	P15108	705 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	URK1	P27515	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	CBF2	P32504	956 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	MNT3	P40549	630 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	VPS4	P52917	437 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	COG1	P53079	417 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	DCP2	P53550	970 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	IDP3	P53982	420 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	SNU56	Q03782	492 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TFC6	Q06339	672 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YOR389W	Q08912	624 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	RPN12	P32496	274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	FTH1	P38310	465 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	BSC5	P53755	489 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	GEP3	Q08622	556 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	CRC1	Q12289	327 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	RRI2	Q12348	645 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	SKM1	Q12469	655 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	MAK32	P23060	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	PHM8	P40025	321 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	COG4	Q06096	861 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	RAD34	Q06665	692 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TRM8	Q12009	286 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	IMP2'	P32351	346 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	HES1	P35843	434 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	NOP4	P37838	685 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	IRC7	P43623	340 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	BNA1	P47096	177 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	MEP3	P53390	489 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ENT1	Q12518	454 aa		4.93	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	GUK1	P15454	187 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	LAC1	P28496	418 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	AXL2	P38928	823 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ERP2	P39704	215 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	BUD16	P39988	312 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YJR061W	P40355	935 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ASG1	P40467	964 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	CIN1	P40987	1014 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TAM41	P53230	385 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YGR079W	P53249	370 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	RTP1	Q12751	981 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ILV2	P07342	687 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	CDC24	P11433	854 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ERC1	P38767	581 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	ERV46	P39727	415 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YIL024C	P40543	189 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	MPS1	P54199	764 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	YAT1	P80235	687 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TSR2	Q06672	205 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	TMA16	Q08687	178 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CDA2	YLR308W	SEM1	O94742	89 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SRB5	P32585	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	SAC6	P32599	642 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	FLO5	P38894	1075 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MRX1	P40050	688 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	MUB1	Q03162	620 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	PFA4	Q12006	378 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	RPB2	P08518	1224 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CDA2	YLR308W	COQ3	P27680	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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