RNA–Protein interactions for RNA: YLR079W

SIC1, Transcript of Cyclin-dependent kinase inhibitor (CKI), yeast

Gene SIC1, Length 855 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIC1	YLR079W	CNS1	P33313	385 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	RIC1	P40395	1056 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	CIN1	P40987	1014 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	NET1	P47035	1189 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	COG1	P53079	417 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	GTR1	Q00582	310 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	NBP2	Q12163	236 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	GSH1	P32477	678 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	SLC1	P33333	303 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	EXO84	P38261	753 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	MRX1	P40050	688 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	UBP7	P40453	1071 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	VTC3	Q02725	835 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	NEW1	Q08972	1196 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
SIC1	YLR079W	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	RER1	P25560	188 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	COQ3	P27680	312 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	IFA38	P38286	347 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	IMD2	P38697	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	CFD1	P40558	293 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	RPN11	P43588	306 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	RSC9	Q03124	581 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	TFC6	Q06339	672 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SWA2	Q06677	668 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	OPY2	Q06810	360 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	NUS1	Q12063	375 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	GET3	Q12154	354 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	FRE7	Q12333	620 aa		4.58	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	LHS1	P36016	881 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	ARN1	P38731	627 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	VPS4	P52917	437 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YML131W	Q03102	365 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	VID22	Q05934	901 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	TMA16	Q08687	178 aa		4.57	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YLR302C	O13544	120 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SSH4	P32343	579 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SRB5	P32585	307 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	RRN3	P36070	627 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	GEX2	P36173	615 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	AAP1	P37898	856 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	TOM71	P38825	639 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SPC97	P38863	823 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	JHD1	P40034	492 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	MNT3	P40549	630 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YJL107C	P42947	387 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	ADE16	P54113	591 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	RCO1	Q04779	684 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	CRC1	Q12289	327 aa		4.56	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	MDM10	P18409	493 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	OCT1	P35999	772 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SEC31	P38968	1273 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YER010C	P40011	234 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	UBP8	P50102	471 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	COP1	P53622	1201 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	STP1	Q00947	519 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YMR018W	Q04364	514 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	STP3	Q05937	343 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	CRN1	Q06440	651 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YLR049C	Q12110	428 aa		4.55	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	PCT1	P13259	424 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	ERV46	P39727	415 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	FCP1	Q03254	732 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	MRPL1	Q04599	285 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	PDR8	Q06149	701 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	AFT2	Q08957	416 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	TRM8	Q12009	286 aa		4.54	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	TOP1	P04786	769 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YMR085W	P0CF18	432 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YSP3	P25036	478 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YPR003C	P53394	754 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	IST1	P53843	298 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	SWF1	Q04629	336 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	MCH4	Q08268	501 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	VCX1	Q99385	411 aa		4.53	□□□□□ -1.68
SIC1	YLR079W	YAP1	P19880	650 aa	Known RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	CBF2	P32504	956 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	NTR2	P36118	322 aa	Predicted RBP	4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	YIL024C	P40543	189 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	CDC1	P40986	491 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	BNA1	P47096	177 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	MUB1	Q03162	620 aa		4.52	□□□□□ -1.69
SIC1	YLR079W	PIG1	Q06216	648 aa		4.52	□□□□□ -1.69

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