RNA–Protein interactions for RNA: YKR080W

MTD1, Transcript of NAD-dependent 5,10-methylenetetrahydrafolate dehydrogenase, yeast

Gene MTD1, Length 963 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MTD1	YKR080W	COG2	P53271	262 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	ARO10	Q06408	635 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	YDL242W	Q07746	117 aa		4.67	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	PNO1	Q99216	274 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	SEC3	P33332	1336 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	RAD16	P31244	790 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	SIP1	P32578	815 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	BEM3	P32873	1128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	RPC34	P32910	317 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	IML2	P47031	731 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	YJL043W	P47053	257 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	ECM16	Q04217	1267 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	RAD33	Q04231	177 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	YML053C	Q04978	212 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	CSR1	Q06705	408 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	LCB4	Q12246	624 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	TY4B-H	P0C2J7	1802 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	TY4B-J	P47024	1803 aa		4.65	□□□□□ -1.66
MTD1	YKR080W	IFA38	P38286	347 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TDA10	P42938	290 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	AAT1	Q01802	451 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	YML131W	Q03102	365 aa		4.65	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TPK1	P06244	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RRP43	P25359	394 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	URK1	P27515	501 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RPF2	P36160	344 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	FLO10	P36170	1169 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	EXO1	P39875	702 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	CTF18	P49956	741 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	PLM2	Q04383	521 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	COX17	Q12287	69 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RVB2	Q12464	471 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	Q0010	Q9ZZX9	128 aa		4.64	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	AQY1	P0CD91	305 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	YJU2	P28320	278 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	ERC1	P38767	581 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	UME6	P39001	836 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SAP1	P39955	897 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	YGR079W	P53249	370 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	MTG1	Q03151	367 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	GTB1	Q04924	702 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	PFK2	P16862	959 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.62	□□□□□ -1.67	not detected
MTD1	YKR080W	SLC1	P33333	303 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	NUP120	P35729	1037 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	FUN12	P39730	1002 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TAX4	P47030	604 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	BNA1	P47096	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	IMO32	P53219	342 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	HRD3	Q05787	833 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	STP3	Q05937	343 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TFC6	Q06339	672 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	CYK3	Q07533	885 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	YPL191C	Q08930	360 aa		4.62	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	FKS3	Q04952	1785 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	ATP2	P00830	511 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SSH4	P32343	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RPT3	P33298	428 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	BUD16	P39988	312 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	NPA3	P47122	385 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	COG1	P53079	417 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	VID22	Q05934	901 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SSP2	Q08646	371 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	OSW1	Q08692	278 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	RAD9	P14737	1309 aa		4.61	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	COX1	P00401	534 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SNF1	P06782	633 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SES1	P07284	462 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	HOT13	P36078	116 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	KAP123	P40069	1113 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	YIL161W	P40449	235 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	CIR1	P42940	261 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	UBX6	P47049	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	PSP1	P50896	841 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	ATG23	Q06671	453 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	PCD1	Q12524	340 aa		4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	BI2	P03873	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	SPO16	P17122	198 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	GSY2	P27472	705 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	LAC1	P28496	418 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	PEX2	P32800	271 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	CNS1	P33313	385 aa		4.59	□□□□□ -1.67
MTD1	YKR080W	KES1	P35844	434 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 17.6 ms