RNA–Protein interactions for RNA: YKR078W

YKR078W, Transcript of Cytoplasmic protein of unknown function, yeastyeast

Gene YKR078W, Length 1,758 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YKR078WYKR078W CDC1P40986 491 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ASK10P48361 1146 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W FOL1P53848 824 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W CEG1Q01159 459 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YMR034CQ05131 434 aaPredicted RBP3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MLH2Q07980 695 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W DSE3Q08729 430 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ICL2Q12031 575 aa3.05□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SNQ2P32568 1501 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W COX1P00401 534 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YFL068WP0CX99 160 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YLL066W-AP0CY00 160 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YLL067W-AP0CY01 160 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W CCT4P39078 528 aaKnown RBP3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YNL144CP53907 740 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W PDR8Q06149 701 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W GSH2Q08220 491 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YPK9Q12697 1472 aa3.04□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MRC1P25588 1096 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W LAC1P28496 418 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W SWC3P31376 625 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W MSS51P32335 436 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W VPS41P38959 992 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W YOR1P53049 1477 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W GEA1P47102 1408 aaPredicted RBP3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W ESP1Q03018 1630 aa3.03□□□□□ -1.92
YKR078WYKR078W RPL42AP0CX27 106 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W RPL42BP0CX28 106 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W FRD1P32614 470 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W NIC96P34077 839 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W HES1P35843 434 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W VPS24P36095 224 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W MET30P39014 640 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W TPA1P40032 644 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W DJP1P40564 432 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W SMC3P47037 1230 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YRB30P53107 440 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W CDC45Q08032 650 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W ARP7Q12406 477 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W EDE1P34216 1381 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W NUP159P40477 1460 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YCF1P39109 1515 aaKnown RBP3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W PCT1P13259 424 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W OCT1P35999 772 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W NRT1Q08485 598 aa3.02□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W SPC110P32380 944 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W MAD3P47074 515 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YGR079WP53249 370 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W PIG1Q06216 648 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YOR111WQ99210 232 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W RKR1Q04781 1562 aa3.01□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W RPP0P05317 312 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W MSP1P28737 362 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W VPS27P40343 622 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YIL169CP40442 995 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W TGL2P54857 326 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W ECM16Q04217 1267 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W GRS2Q06817 618 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YLR112WQ12130 139 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W PDR15Q04182 1529 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W STT3P39007 718 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W UBX6P47049 396 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YGL036WP53185 909 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YDR109CQ04585 715 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W MCH4Q08268 501 aa3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W RVB2Q12464 471 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W HSP82P02829 709 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W URK1P27515 501 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W DIG1Q03063 452 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W GTB1Q04924 702 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W FRE3Q08905 711 aa2.99□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W SIR1P21691 654 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YCR006CP25350 157 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W BUD16P39988 312 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W PCL6P40038 420 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W TPM2P40414 161 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W CAB2P40506 365 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W QRI7P43122 407 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W VPS25P47142 202 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W MSY1P48527 492 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W GIS2P53849 153 aaKnown RBP RIP-Chip data2.98□□□□□ -1.93not detected
YKR078WYKR078W CAC2Q04199 468 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W PDS5Q04264 1277 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W SUL2Q12325 893 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W TRM3Q07527 1436 aa2.98□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W GCN2P15442 1659 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W VPS15P22219 1454 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W DSN1P40568 576 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W UBP8P50102 471 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YGL260WP53056 76 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W TAM41P53230 385 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YTH1Q06102 208 aaPredicted RBP2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W POS5Q06892 414 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W LSP1Q12230 341 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W YOL114CQ12322 202 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W DNF1P32660 1571 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W SSB1P11484 613 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W MNN2P38069 597 aa2.97□□□□□ -1.93
YKR078WYKR078W TCD1P38756 429 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.6 ms