RNA–Protein interactions for RNA: YHR135C

YCK1, Transcript of Palmitoylated plasma membrane-bound casein kinase I (CK1) isoform, yeast

Gene YCK1, Length 1,617 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YCK1	YHR135C	SLT2	Q00772	484 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YML119W	Q03208	357 aa		6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SEC14	P24280	304 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YCL068C	P25593	260 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PDB1	P32473	366 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	DSS4	P32601	143 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PEP7	P32609	515 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CYM1	P32898	989 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GRS1	P38088	690 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	HSM3	P38348	480 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ERP5	P38819	212 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LAM1	P38851	1228 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YDR089W	P38966	869 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PEP8	P40335	379 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CCT8	P47079	568 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LSC1	P53598	329 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PNG1	Q02890	363 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YPL109C	Q02981	657 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YMR209C	Q03648	457 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	AAD15	Q08361	143 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SLD7	Q08457	257 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LDB17	Q12342	491 aa		6.24	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PRC1	P00729	532 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GPA2	P10823	449 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	APE1	P14904	514 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MLS1	P30952	554 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GDA1	P32621	518 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RRN3	P36070	627 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	POA1	P38218	177 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SNG1	P46950	547 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TAF6	P53040	516 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TIM13	P53299	105 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GND2	P53319	492 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YPL034W	Q03083	165 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	GCN5	Q03330	439 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	HER2	Q03557	464 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ADI1	Q03677	179 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YLR177W	Q06251	628 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	ECM30	Q06673	1274 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	LCB4	Q12246	624 aa		6.23	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RAD3	P06839	778 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MSD1	P15179	658 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	IDI1	P15496	288 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RPC19	P28000	142 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MET4	P32389	672 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MRS6	P32864	603 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	COY1	P34237	679 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	STN1	P38960	494 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MGS1	P40151	587 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CHS6	P40955	746 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TAF1	P46677	1066 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SWC7	Q06707	132 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	OSW1	Q08692	278 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SPE3	Q12074	293 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SPE4	Q12455	300 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YPT6	Q99260	215 aa		6.22	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	COX5A	P00424	153 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MAS1	P10507	462 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	HSF1	P10961	833 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	KGD2	P19262	463 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MSN1	P22148	382 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RRP14	P36080	434 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YBR225W	P38321	900 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PHO89	P38361	574 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	RFC3	P38629	340 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	SSP120	P39931	234 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YFL052W	P43551	465 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	TRM112	P53738	135 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	CEG1	Q01159	459 aa	Predicted RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PIR3	Q03180	325 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	MRI1	Q06489	411 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	PMT7	Q06644	662 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YDL073W	Q07454	984 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	APC9	Q12107	265 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	HOS1	Q12214	470 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	OCA6	Q12454	224 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	AFI1	Q99222	893 aa		6.21	□□□□□ -1.41
YCK1	YHR135C	UBR1	P19812	1950 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	ATP1	P07251	545 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	HSP26	P15992	214 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.21	□□□□□ -1.42	not detected
YCK1	YHR135C	GAL11	P19659	1081 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	SNT1	P25357	1226 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	NDI1	P32340	513 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	SMI1	P32566	505 aa		6.21	□□□□□ -1.42
YCK1	YHR135C	YKR051W	P36142	418 aa		6.21	□□□□□ -1.42

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