RNA–Protein interactions for RNA: YGL219C

MDM34, Transcript of Mitochondrial component of the ERMES complex, yeast

Gene MDM34, Length 1,380 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MDM34	YGL219C	IMD4	P50094	524 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	KAP114	P53067	1004 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PCL10	P53124	433 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YGR012W	P53206	393 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YAP1802	P53309	568 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	TNA1	P53322	534 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	MEP3	P53390	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	MNT4	P53745	580 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YNR068C	P53754	272 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RMD1	Q03441	430 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YDL114W	Q07530	308 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YPL260W	Q08977	551 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	DAS2	Q12084	232 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YPL066W	Q12194	479 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	MMS22	Q06164	1454 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	LAM4	P38800	1345 aa		4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	THO2	P53552	1597 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	COQ4	O13525	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	KIN3	P22209	435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RPS7A	P26786	190 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	VMA6	P32366	345 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	OCT1	P35999	772 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	MCM7	P38132	845 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	STP2	P38704	541 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	TPA1	P40032	644 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	FCY21	P40039	528 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
MDM34	YGL219C	FMS1	P50264	508 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RAI1	P53063	387 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	LIF1	P53150	421 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YGR127W	P53275	312 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	BRE5	P53741	515 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	HEF3	P53978	1044 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	GTR1	Q00582	310 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	MAK10	Q02197	733 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	ARA2	Q04212	335 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	GYL1	Q04322	720 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	THI3	Q07471	609 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	FAL1	Q12099	399 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YPR022C	Q12139	1133 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PSF3	Q12146	194 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	MSH5	Q12175	901 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	BBP1	Q12365	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	ATG11	Q12527	1178 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	SPP41	P38904	1435 aa		4.54	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YPR089W	O13585	888 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	SEC62	P21825	274 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	CLB4	P24871	460 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	KCC4	P25389	1037 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	DBF20	P32328	564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PMT1	P33775	817 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	CAF4	P36130	643 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	NTC20	P38302	140 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	GND1	P38720	489 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	AXL1	P40851	1208 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	BNA3	P47039	444 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	FAA4	P47912	694 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	UPF3	P48412	387 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YDL183C	P48569	320 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	GCV2	P49095	1034 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RMR1	P53060	241 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	CGR1	P53188	120 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	FIN1	Q03898	291 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PIG1	Q06216	648 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	DXO1	Q06349	442 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	OMS1	Q06668	471 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	TGS1	Q12052	315 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	TAH18	Q12181	623 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	GIS3	Q12418	502 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PGA3	Q12746	312 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	PDR10	P51533	1564 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	RAV1	P47104	1357 aa		4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
MDM34	YGL219C	ARD1	P07347	238 aa	Predicted RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	KRS1	P15180	591 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	FUR1	P18562	216 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	YCR101C	P25607	182 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	SIN4	P32259	974 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	PAH1	P32567	862 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	YBL010C	P32788	280 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	RFC3	P38629	340 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	VMA22	P38784	181 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	SSO2	P39926	295 aa		4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	RPN3	P40016	523 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.69
MDM34	YGL219C	LOH1	P47055	219 aa		4.53	□□□□□ -1.69

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