RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	FIG2	P25653	1609 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NSP1	P14907	823 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RGR1	P19263	1082 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ATG22	P25568	528 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EAP1	P36041	632 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RRN3	P36070	627 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MRPL37	P36532	105 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DIA4	P38705	446 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SMF2	P38778	549 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	APE4	P38821	490 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EMP47	P43555	445 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YGR237C	P50089	785 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NUT1	P53114	1132 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TWF1	P53250	332 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CPR6	P53691	371 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YNL146W	P53906	100 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	UME1	Q03010	460 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	JIP4	Q03361	876 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PNP1	Q05788	311 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TDA5	Q06417	326 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	HIM1	Q06674	414 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TYW1	Q08960	810 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	HER1	Q12276	1246 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	AI5_ALPHA	Q9ZZX1	630 aa		3.65	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	THS1	P04801	734 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RNR3	P21672	869 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SGV1	P23293	657 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YCR101C	P25607	182 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PDC6	P26263	563 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	FBP26	P32604	452 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	STV1	P37296	890 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EDS1	P38073	919 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DUG2	P38149	878 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SEA4	P38164	1038 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YHR202W	P38887	602 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SEO1	P39709	593 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YER184C	P39961	794 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PFK26	P40433	827 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CIN5	P40917	295 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GUS1	P46655	708 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.64	□□□□□ -1.83	not detected
XRS2	YDR369C	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DIE2	P50076	525 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MND1	P53102	219 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YGR122W	P53272	402 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DSE4	P53753	1117 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	EEB1	Q02891	456 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	COS7	Q07788	383 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MSC6	Q08818	692 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SNX3	Q08826	162 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	AKR2	Q12013	749 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PSF3	Q12146	194 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	OSW2	Q12202	724 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ZRT2	Q12436	422 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	COR1	P07256	457 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ERG12	P07277	443 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RGP1	P16664	663 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	VPS33	P20795	691 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SPT14	P32363	452 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	TFB1	P32776	642 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ORC2	P32833	620 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YHR045W	P38775	560 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ATG7	P38862	630 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CEM1	P39525	442 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	SOK1	P40317	901 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PSF2	P40359	213 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MMM1	P41800	426 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GYP8	P43570	497 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RPE1	P46969	238 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RPC17	P47076	161 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	COG1	P53079	417 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ARO8	P53090	500 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	NMA2	P53204	395 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	MRPS35	P53292	345 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	CAF120	P53836	1060 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ASI2	P53895	289 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ECM23	Q02710	187 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	VHS1	Q03785	461 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	BUR2	Q05949	395 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	GMC2	Q06201	188 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	YFT2	Q06676	274 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	INP54	Q08227	384 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	ALE1	Q08548	619 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	DSE3	Q08729	430 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	FEX2	Q08991	375 aa		3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	WRS1	Q12109	432 aa	Known RBP	3.64	□□□□□ -1.83
XRS2	YDR369C	RRI2	Q12348	645 aa		3.64	□□□□□ -1.83

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