RNA–Protein interactions for RNA: YDR247W

VHS1, Transcript of Cytoplasmic serine/threonine protein kinase, yeastyeast

Gene VHS1, Length 1,386 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1YDR247W YJR079WP47126 109 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MNN10P50108 393 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MCM6P53091 1017 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CWC22P53333 577 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YLR287CQ05881 355 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W TFC6Q06339 672 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CRD1Q07560 283 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NOP6Q07623 225 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W AAD4Q07747 329 aa5.8□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YLR358CO13565 187 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NUC1P08466 329 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W TUP1P16649 713 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W FEN2P25621 512 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PSO2P30620 661 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MVD1P32377 396 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CNS1P33313 385 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SWH1P35845 1188 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YBR053CP38235 358 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RXT2P38255 430 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SFB3P38810 929 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W VPS8P39702 1274 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PUG1P40100 303 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PCI8P40512 444 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YDL183CP48569 320 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RPS15Q01855 142 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W FDC1Q03034 503 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W YFT2Q06676 274 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W IWR1Q07532 353 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W SDH5Q08230 162 aa5.79□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W HIS4P00815 799 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CLB4P24871 460 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RER1P25560 188 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PAP1P29468 568 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W MCM10P32354 571 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W BCS1P32839 456 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W RPT3P33298 428 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W LYS14P40971 790 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W GSM1P42950 618 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W AIP1P46680 615 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W NRD1P53617 575 aaKnown RBP RIP-Chip data5.78□□□□□ -1.48 RIP-Chip
VHS1YDR247W NGL3Q03210 505 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W STE23Q06010 1027 aa5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W CLF1Q12309 687 aaPredicted RBP5.78□□□□□ -1.48
VHS1YDR247W PCK1P10963 549 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SEC12P11655 471 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W NCP1P16603 691 aaKnown RBP5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CKI1P20485 582 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PRP28P23394 588 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ANP1P32629 500 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RPC25P35718 212 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RRN3P36070 627 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MRPL36P36531 177 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W VFA1P40080 203 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PSF2P40359 213 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ACS1Q01574 713 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PRP3Q03338 469 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W INM2Q05533 292 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ENT1Q12518 454 aa5.77□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CDC8P00572 216 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PPR1P07272 904 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W PRP16P15938 1071 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ALG1P16661 449 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CHS3P29465 1165 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W DCG1P32460 244 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SLC1P33333 303 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W EHT1P38295 451 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W KAP123P40069 1113 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CSM2P40465 213 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MNT3P40549 630 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W TRS85P46944 698 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RFX1P48743 811 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ARA2Q04212 335 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YOL075CQ08234 1294 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CHS5Q12114 671 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CEX1Q12453 761 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YOR111WQ99210 232 aa5.76□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RIT1P23796 513 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W FRD1P32614 470 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MYO3P36006 1272 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W REV7P38927 245 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YMR124WP39523 943 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W TMN3P40071 706 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W UBC11P52492 156 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RTC4P53850 401 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SOV1Q04748 898 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RGC1Q06108 1083 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W TIP41Q12199 356 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ZRT2Q12436 422 aa5.75□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CYB2P00175 591 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W SRP54P20424 541 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W RNR3P21672 869 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W NTH1P32356 751 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W HIS7P33734 552 aaKnown RBP5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YBR138CP38277 524 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W YSW1P38280 609 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ERG7P38604 731 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W CAB2P40506 365 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W BUL1P48524 976 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W MEP3P53390 489 aa5.74□□□□□ -1.49
VHS1YDR247W ENT2Q05785 613 aa5.74□□□□□ -1.49
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