RNA–Protein interactions for RNA: Q0143

Q0143, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0143, Length 153 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0143	Q0143	UTH1	P36135	365 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	0.52	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	GUD1	Q07729	489 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RFM1	Q12192	310 aa		0.52	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	0.51	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	YME1	P32795	747 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	ERC1	P38767	581 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	VID28	P40547	921 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RET2	P43621	546 aa		0.51	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	CDC26	P14724	124 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	SIP1	P32578	815 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	MIC60	P36112	540 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	STB5	P38699	743 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	PEF1	P53238	335 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	MDR1	P53258	950 aa		0.5	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	ERG1	P32476	496 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	YEN1	P40028	759 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	IKS1	P47042	667 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	TMA64	Q04600	565 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	YOR387C	Q08910	206 aa		0.49	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	YIM1	P28625	365 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	DGR2	P32330	852 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	SWD3	P38123	315 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RPR2	P40571	144 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RTT101	P47050	842 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	YRB30	P53107	440 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	GRC3	Q07845	632 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RRG7	Q08774	242 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	HRT3	Q12347	344 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	YCL021W-A	Q96VH3	125 aa		0.48	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	AEP2	P22136	580 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	NAM9	P27929	486 aa		0.47	□□□□□ -2.33
Q0143	Q0143	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	RFS1	P38234	210 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	YGR210C	P42942	411 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	GUF1	P46943	645 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	IDS2	P46958	469 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	SGF73	P53165	657 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	TAM41	P53230	385 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	HST1	P53685	503 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	ARP10	Q04549	284 aa		0.46	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	CHZ1	P40019	153 aa	Predicted RBP	0.45	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	YLR049C	Q12110	428 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	EDE1	P34216	1381 aa		0.45	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	CCH1	P50077	2039 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	PMR1	P13586	950 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	GID7	P25569	745 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	LAC1	P28496	418 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	NPA3	P47122	385 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	ASI1	P54074	624 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	RBD2	Q12270	262 aa		0.44	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	SPT15	P13393	240 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	ERG7	P38604	731 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	RPT2	P40327	437 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	HAL1	Q01766	294 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	RPM2	Q02773	1202 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	YLR455W	Q06188	304 aa		0.43	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	CLN3	P13365	580 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	PCL1	P24867	279 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	CWH43	P25618	953 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	OAF3	P36023	863 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	FAT1	P38225	669 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	TSA2	Q04120	196 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	YBL111C	Q3E7Y5	667 aa		0.42	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	MTF1	P14908	341 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	MAK10	Q02197	733 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	YEH2	Q07950	538 aa		0.41	□□□□□ -2.34
Q0143	Q0143	SUI3	P09064	285 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	NDC1	P32500	655 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.4	□□□□□ -2.35	not detected
Q0143	Q0143	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	HXT7	P39004	570 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	SHY1	P53266	389 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	UGO1	Q03327	502 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	CRF1	Q04930	467 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YOL098C	Q12496	1037 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YER078W-A	Q3E7A2	54 aa		0.4	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	HXT4	P32467	576 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	NDT80	P38830	627 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	HXT9	P40885	567 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	0.39	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YPR091C	Q06833	770 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	IES4	Q08561	116 aa		0.39	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	SUP35	P05453	685 aa	Known RBP	0.38	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	RCK2	P38623	610 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YGR153W	P48238	217 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YHM2	Q04013	314 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	AYT1	Q12226	474 aa		0.38	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	COX1	P00401	534 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	HEM2	P05373	342 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	STE50	P25344	346 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	SPC110	P32380	944 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YBL059W	P34224	193 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	YER130C	P39959	443 aa		0.37	□□□□□ -2.35
Q0143	Q0143	PEA2	P40091	420 aa		0.37	□□□□□ -2.35

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.2 ms