RNA–Protein interactions for RNA: YPL207W

TYW1, Iron-sulfer protein required for synthesis of Wybutosine modified tRNA, yeast

Gene TYW1, Length 2,433 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TYW1	YPL207W	KEL2	P50090	882 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	GIS4	Q04233	774 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	SPH1	Q06160	661 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	PLP2	Q12017	286 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	YRF1-4	O13559	1382 aa		4.65	□□□□□ -1.66
TYW1	YPL207W	YLR302C	O13544	120 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PRC1	P00729	532 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PCK1	P10963	549 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ARG1	P22768	420 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MRPL25	P23369	157 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CLB3	P24870	427 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MTC7	P32633	139 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	COY1	P34237	679 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	LEM3	P42838	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CSL4	P53859	292 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	IRC20	Q06554	1556 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ICL2	Q12031	575 aa		4.65	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	DAP2	P18962	818 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ERV1	P27882	189 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MSP1	P28737	362 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MUP3	P38734	546 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	OTU2	P38747	307 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SPT8	P38915	602 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	BRE2	P43132	505 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ORC4	P54791	529 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	EFR3	Q03653	782 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ROY1	Q04847	553 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SPO14	P36126	1683 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPP1A	P05318	106 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-LR1	P0C2J4	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-F	P0CX61	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-GR2	P0CX62	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-C	P25383	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SRP101	P32916	621 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YBL029W	P38201	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	POA1	P38218	177 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CST26	P38226	397 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YSW1	P38280	609 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YDR089W	P38966	869 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PRK1	P40494	810 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	BUD8	P41698	603 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YJL045W	P47052	634 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RIA1	P53893	1110 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-DR2	Q03483	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GPB1	Q08886	897 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-B	Q12260	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-OR2	Q12293	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-DR1	Q12392	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-OR1	Q12439	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TY2A-DR3	Q99303	438 aa		4.64	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	LTE1	P07866	1435 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RAS1	P01119	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SMC2	P38989	1170 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MPT5	P39016	859 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.63	□□□□□ -1.67	not detected
TYW1	YPL207W	RRT14	P40470	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	CAB2	P40506	365 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	IST3	P40565	148 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TEL2	P53038	688 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	LSB1	P53281	241 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	NGL2	Q03264	515 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YSH1	Q06224	779 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	VAM6	Q07468	1049 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RCL1	Q08096	367 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SUL2	Q12325	893 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YLR358C	O13565	187 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	YML002W	P0CF17	737 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PHO84	P25297	587 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPD3	P32561	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	LRG1	P35688	1017 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	AAD10	P47182	288 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GLO1	P50107	326 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	REG1	Q00816	1014 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ADY4	Q05955	493 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GPR1	Q12361	961 aa		4.63	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	GDB1	Q06625	1536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	DIT1	P21623	536 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SNT1	P25357	1226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPC82	P32349	654 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	TYE7	P33122	291 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MRPL40	P36534	297 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	ALT2	P52892	507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	INN1	P53901	409 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	DAK1	P54838	584 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	MCP2	Q06567	569 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RIM20	Q12033	661 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	HER1	Q12276	1246 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	SPE4	Q12455	300 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	PDR12	Q02785	1511 aa		4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPL1A	P0CX43	217 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
TYW1	YPL207W	RPL1B	P0CX44	217 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.7 ms