RNA–Protein interactions for RNA: YOR328W

PDR10, Transcript of ATP-binding cassette (ABC) transporter, yeast

Gene PDR10, Length 4,695 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PDR10	YOR328W	YBR053C	P38235	358 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MUM2	P38236	366 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YAP1801	P38856	637 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	VAC8	P39968	578 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RGI2	P40188	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	PXA1	P41909	870 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	COQ6	P53318	479 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YNR063W	P53749	607 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	HER2	Q03557	464 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RPN5	Q12250	445 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	BI2	P03873	423 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	BI4	P03879	638 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SLA2	P33338	968 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	COY1	P34237	679 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YKR023W	P36119	530 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	RPS0B	P46654	252 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	FAR3	P46671	204 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YNL011C	P53980	444 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	YMR187C	Q03236	431 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	MCM21	Q06675	368 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PDR10	YOR328W	COX6	P00427	148 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HXT1	P32465	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	STE5	P32917	917 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CRP1	P38845	465 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LAM1	P38851	1228 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TRS85	P46944	698 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SHR3	Q02774	210 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NDJ1	Q12366	352 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RRP12	Q12754	1228 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ADH4	P10127	382 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	URA10	P30402	227 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	OAF3	P36023	863 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PEX28	P38848	579 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RAD55	P38953	406 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	UBP6	P43593	499 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CSN12	P47130	423 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MRK1	P50873	501 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YDR056C	Q12025	205 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CHS5	Q12114	671 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NMT1	P14743	455 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	VPS34	P22543	875 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GUT1	P32190	709 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YME1	P32795	747 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MPH1	P40562	993 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NMA111	P53920	997 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YLR053C	Q12026	108 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	FCF2	Q12035	217 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ENO2	P00925	437 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CBS2	P14905	389 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	DCC1	P25559	380 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	AIM23	P47015	356 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RSM26	P47141	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PIG1	Q06216	648 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LDB18	Q07887	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CMR1	Q12510	522 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SRN2	Q99176	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GCR1	P07261	785 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HSF1	P10961	833 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RAM1	P22007	431 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	FES1	P38260	290 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ATM1	P40416	690 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YFR018C	P43599	363 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PRY3	P47033	881 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RFX1	P48743	811 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YMR160W	Q03823	816 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TDA9	Q04545	1251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	LDB19	Q12502	818 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	FUS1	P11710	512 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	CYS3	P31373	394 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HES1	P35843	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	DUG2	P38149	878 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YEL023C	P39992	682 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TMA108	P40462	946 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YNR065C	P53751	1116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	TOF2	Q02208	771 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ADA2	Q02336	434 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	HFD1	Q04458	532 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	SPC24	Q04477	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GAD1	Q04792	585 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	ECM30	Q06673	1274 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GNT1	Q12096	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	GPA2	P10823	449 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	YPK1	P12688	680 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	PUF4	P25339	888 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.94	□□□□□ -1.62	not detected
PDR10	YOR328W	KAR9	P32526	644 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	BEM3	P32873	1128 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	MET18	P40469	1032 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	RRT5	P43607	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDR10	YOR328W	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62

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