RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	WHI3	P34761	661 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YUH1	P35127	236 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YKR073C	P36153	106 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PCH2	P38126	564 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SIF2	P38262	535 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HXT7	P39004	570 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PXA1	P41909	870 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	CTF18	P49956	741 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HFM1	P51979	1187 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YGR266W	P53326	701 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	TOF1	P53840	1238 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HOS3	Q02959	697 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	INP2	Q03824	705 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	NHX1	Q04121	633 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YDR514C	Q04408	483 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	MET7	Q08645	548 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	TRM8	Q12009	286 aa		5.48	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	VAS1	P07806	1104 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	ADP1	P25371	1049 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	MSP1	P28737	362 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	LIP5	P32875	414 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SUR1	P33300	382 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	GCS1	P35197	352 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YKT6	P36015	200 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	OAF3	P36023	863 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	MRPL36	P36531	177 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	POL12	P38121	705 aa	Predicted RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	RPN10	P38886	268 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YMR124W	P39523	943 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	AIM10	P39965	576 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PUG1	P40100	303 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	YJL070C	P40361	888 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SHE4	P51534	789 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	TEL2	P53038	688 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	RPN14	P53196	417 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	DAM1	P53267	343 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.47	□□□□□ -1.53	not detected
YMD8	YML038C	BSC5	P53755	489 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	KIN4	Q01919	800 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	ATP25	Q03153	612 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	VBA4	Q04602	768 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SNO4	Q04902	237 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HRQ1	Q05549	1077 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	TSR1	Q07381	788 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HSP32	Q08992	237 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	HUA2	Q12134	243 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	PSF3	Q12146	194 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	SKM1	Q12469	655 aa		5.47	□□□□□ -1.53
YMD8	YML038C	MLP1	Q02455	1875 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PHO5	P00635	467 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TPK1	P06244	397 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SEC53	P07283	254 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PRP22	P24384	1145 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CLB1	P24868	471 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	DMC1	P25453	334 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	DPH5	P32469	300 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YEL043W	P32618	956 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YKL151C	P36059	337 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	STB6	P36085	766 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	IFA38	P38286	347 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YHR202W	P38887	602 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SPO22	P40511	975 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	THI6	P41835	540 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SSU1	P41930	458 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	MET12	P46151	657 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	STU2	P46675	888 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YJR039W	P47107	1121 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	INP52	P50942	1183 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	VID30	P53076	958 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	RRT6	P53117	311 aa	Predicted RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YGL082W	P53155	381 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	EFM5	P53200	248 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	SNF12	P53628	566 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TOF2	Q02208	771 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TPP1	Q03796	238 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	HRK1	Q08732	759 aa	Known RBP	5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	MCH5	Q08777	521 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	HMI1	Q12039	706 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TGL5	Q12043	749 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	ADF1	Q2V2Q1	113 aa		5.46	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YML002W	P0CF17	737 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	KSS1	P14681	368 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	not detected
YMD8	YML038C	VPS3	P23643	1011 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CLB4	P24871	460 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	OCA4	P25366	362 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.45	□□□□□ -1.54	RIP-Chip
YMD8	YML038C	EMC3	P36039	253 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	UTP18	P40362	594 aa	Predicted RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	YJL045W	P47052	634 aa		5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	TRF5	P48561	642 aa	Known RBP	5.45	□□□□□ -1.54
YMD8	YML038C	NIT3	P49954	291 aa		5.45	□□□□□ -1.54

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