RNA–Protein interactions for RNA: YHR039C

MSC7, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC7, Length 1,935 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC7	YHR039C	OMS1	Q06668	471 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PSY3	Q12318	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PDH1	Q12428	516 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RAV1	P47104	1357 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	ARG3	P05150	338 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GAL7	P08431	366 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	UNG1	P12887	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GIT1	P25346	518 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SUA5	P32579	426 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CSE4	P36012	229 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MCM7	P38132	845 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	IRC24	P40580	263 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	LSM1	P47017	172 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	NET1	P47035	1189 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	GCV2	P49095	1034 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YKE2	P52553	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	UTP8	P53276	713 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RCM1	P53972	490 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SMA1	Q02651	245 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RMT2	Q03305	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	DCR2	Q05924	578 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	THI3	Q07471	609 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	DIS3	Q08162	1001 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	ESA1	Q08649	445 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	NCB2	Q92317	146 aa		4.87	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YPR089W	O13585	888 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	AI4	P03878	556 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CHS1	P08004	1131 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PHO3	P24031	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	APL1	P27351	700 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YBL010C	P32788	280 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RAD5	P32849	1169 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	UBX7	P38349	436 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	BOL3	P39724	118 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	LTP1	P40347	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	ICE2	P40499	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CAB2	P40506	365 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MPS3	P47069	682 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SAM37	P50110	327 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CAF120	P53836	1060 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	WAR1	Q03631	944 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PDS5	Q04264	1277 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SEG1	Q04279	960 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HFD1	Q04458	532 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RSF1	Q05043	376 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PUS7	Q08647	676 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PSF3	Q12146	194 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	LDB17	Q12342	491 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	HMS1	Q12398	434 aa		4.86	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PCT1	P13259	424 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	STE12	P13574	688 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	URA4	P20051	364 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PRI2	P20457	528 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	DAL7	P21826	554 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RVS161	P25343	265 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	NGG1	P32494	702 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SEC61	P32915	480 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SRP101	P32916	621 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PCS60	P38137	543 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.85	□□□□□ -1.63	not detected
MSC7	YHR039C	TDP1	P38319	544 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YHL017W	P38745	532 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YDR089W	P38966	869 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RTR1	P40084	226 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YIL089W	P40500	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	VHR1	P40522	640 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	UFE1	P41834	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RMD8	P43620	662 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	AIM14	P53109	570 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	YPL071C	Q02864	156 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SRL4	Q03085	281 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	COX20	Q04935	205 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	LCB5	Q06147	687 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PIB1	Q06651	286 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	OSW2	Q12202	724 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	RTR2	Q12378	196 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	SKM1	Q12469	655 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MDM12	Q92328	271 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	MTR10	Q99189	972 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	TUP1	P16649	713 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PHO81	P17442	1178 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	KGD1	P20967	1014 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	CMK2	P22517	447 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	STE50	P25344	346 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PAT1	P25644	796 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	PHO91	P27514	894 aa		4.85	□□□□□ -1.63
MSC7	YHR039C	ERG3	P32353	365 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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