RNA–Protein interactions for RNA: YER118C

SHO1, Transcript of Transmembrane osmosensor for filamentous growth and HOG pathways, yeastyeast

Gene SHO1, Length 1,104 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHO1YER118C MAE1P36013 669 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C POL12P38121 705 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C STU2P46675 888 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C RPN14P53196 417 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C PDR16P53860 351 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C NGL2Q03264 515 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C VPS64Q03944 604 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C DBP9Q06218 594 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C THI22Q06490 572 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C PUS7Q08647 676 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C NUS1Q12063 375 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C CHS5Q12114 671 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C LYS21Q12122 440 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C SLP1Q12232 587 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C SEC39Q12745 709 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C YJR112W-AQ3E743 109 aa6.8□□□□□ -1.32
SHO1YER118C ATP2P00830 511 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C DFR1P07807 211 aaKnown RBP RIP-Chip data6.79□□□□□ -1.32not detected
SHO1YER118C PET122P10355 254 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C CAF20P12962 161 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C RRP43P25359 394 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C TRK2P28584 889 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C SRP101P32916 621 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C CST26P38226 397 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C TDP1P38319 544 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C TIF5P38431 405 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C SSY5P47002 699 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C ZAP1P47043 880 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C MTR3P48240 250 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C TOF2Q02208 771 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C TRS31Q03337 283 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C ARX1Q03862 593 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C PPN1Q04119 674 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C SSL1Q04673 461 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C NOP6Q07623 225 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C PHM7Q12252 991 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C CTF3Q12748 733 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C VCX1Q99385 411 aa6.79□□□□□ -1.32
SHO1YER118C PYC1P11154 1178 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C DIT1P21623 536 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C KTR3P38130 404 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C SMC2P38989 1170 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C JHD1P40034 492 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C VFA1P40080 203 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C VMA13P41807 478 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C PXA1P41909 870 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C KEL2P50090 882 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C YGR066CP53242 292 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C ARP5P53946 755 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C ASM4Q05166 528 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C GPR1Q12361 961 aa6.78□□□□□ -1.32
SHO1YER118C CTT1P06115 562 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C RPS7AP26786 190 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C CAB3P36076 571 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C INN1P53901 409 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C NAM8Q00539 523 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C MAK10Q02197 733 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C VTC3Q02725 835 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C MUB1Q03162 620 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C ARV1Q06541 321 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C AIM6Q07716 390 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YEH1Q07804 573 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C TMA16Q08687 178 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C SVS1Q12254 260 aa6.77□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YLR358CO13565 187 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C FBP1P09201 348 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C PRE4P30657 266 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YPT7P32939 208 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C LTV1P34078 463 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C SRB2P34162 210 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C COY1P34237 679 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C KES1P35844 434 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YSW1P38280 609 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C OTU2P38747 307 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C REV7P38927 245 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YDR089WP38966 869 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C SLZ1P40167 298 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C DOT5P40553 215 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C ASE1P50275 885 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C ALT2P52892 507 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YGR266WP53326 701 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C DAK1P54838 584 aaKnown RBP6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C TCO89Q08921 799 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C PLP2Q12017 286 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C SPE4Q12455 300 aa6.76□□□□□ -1.33
SHO1YER118C RPL1AP0CX43 217 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C RPL1BP0CX44 217 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C SYN8P31377 255 aa6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C PGM1P33401 570 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C MRPL40P36534 297 aa6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C CTM1P38818 585 aa6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C BPL1P48445 690 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C TAM41P53230 385 aa6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YGR111WP53265 400 aa6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C RPA49Q01080 415 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C UBP2Q01476 1272 aa6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C YMR265CQ03508 461 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
SHO1YER118C MRD1Q06106 887 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
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