RNA–Protein interactions for RNA: YDR369C

XRS2, Transcript of Protein required for DNA repair, yeast

Gene XRS2, Length 2,565 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
XRS2	YDR369C	HAS1	Q03532	505 aa	Known RBP	3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DLT1	Q04216	342 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YMR027W	Q04371	470 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YDR514C	Q04408	483 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RGA2	Q06407	1009 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YLR352W	Q06479	807 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	FEX1	Q08913	375 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	AFT2	Q08957	416 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YOR214C	Q12282	236 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	HMS1	Q12398	434 aa		3.67	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPN13	O13563	156 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CBP2	P03874	630 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	FUR4	P05316	633 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GAL3	P13045	520 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PRI2	P20457	528 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CMK2	P22517	447 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	VMA16	P23968	213 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NTG1	P31378	399 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DBF20	P32328	564 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CUE2	P36075	443 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NUP133	P36161	1157 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YPK3	P38070	525 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RCR1	P38212	213 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YBR138C	P38277	524 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	COS111	P38308	924 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GLG2	P47011	380 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	APP1	P53933	587 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DID2	P69771	204 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	IVY1	Q04934	453 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	COQ9	Q05779	260 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NDE2	Q07500	545 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	AEP3	Q12089	606 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	REX3	Q12090	404 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	LAG2	Q92325	660 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ADR1	P07248	1323 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RPL25	P04456	142 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CLN3	P13365	580 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SDS22	P36047	338 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	AKL1	P38080	1108 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ARA1	P38115	344 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MNN9	P39107	395 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SSO2	P39926	295 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	VFA1	P40080	203 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DPH1	P40487	425 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GTT1	P40582	234 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ALA1	P40825	983 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	IRC6	P43615	237 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	USE1	P53146	245 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SNF12	P53628	566 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MNT4	P53745	580 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SDH1	Q00711	640 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SPP1	Q03012	353 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YMR279C	Q03263	540 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NHP10	Q03435	203 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YDR249C	Q03787	373 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PEX10	Q05568	337 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PUF3	Q07807	879 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.66	□□□□□ -1.82	not detected
XRS2	YDR369C	RSC58	Q07979	502 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GTT2	Q12390	233 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		3.66	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	HXK1	P04806	485 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ARG81	P05085	880 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SCP160	P06105	1222 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.65	□□□□□ -1.82	not detected
XRS2	YDR369C	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	PRP9	P19736	530 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	RIT1	P23796	513 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SEC1	P30619	724 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MRPL7	P36519	292 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GRX7	P38068	203 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YBR139W	P38109	508 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CHK1	P38147	527 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ECM21	P38167	1117 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CDS1	P38221	457 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YHL008C	P38750	627 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MIP6	P38760	659 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	UTP9	P38882	575 aa	Known RBP	3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GPB2	P39717	880 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	GID8	P40208	455 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ACF4	P47129	309 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YJR098C	P47139	656 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	SAP4	P53036	818 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ROM1	P53046	1155 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	FMN1	Q03778	218 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	ARP10	Q04549	284 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	CRR1	Q05790	422 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MHR1	Q06630	226 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	MUM3	Q08750	479 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	YDR061W	Q12298	539 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	NTO1	Q12311	748 aa		3.65	□□□□□ -1.82
XRS2	YDR369C	DCN1	Q12395	269 aa		3.65	□□□□□ -1.82

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