RNA–Protein interactions for RNA: YBL078C

ATG8, Transcript of Component of autophagosomes and Cvt vesicles, yeastyeast

Gene ATG8, Length 354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Peroxisome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG8YBL078C TAH11P47112 604 aa4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C PRP31P49704 494 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C COX18P53239 316 aa4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C CTF4Q01454 927 aa4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C NGL3Q03210 505 aa4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C ACK1Q07622 623 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C GPB1Q08886 897 aa4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C USO1P25386 1790 aa4.6□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C TUB2P02557 457 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C CDC6P09119 513 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C CDC24P11433 854 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C PMS1P14242 873 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C CDC20P26309 610 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C PEP3P27801 918 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C PRE4P30657 266 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C YKL100CP34248 587 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C POP2P39008 433 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C MPT5P39016 859 aaKnown RBP RIP-Chip data4.59□□□□□ -1.67not detected
ATG8YBL078C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C MHP1P43638 1398 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C POL31P46957 487 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C YBP2P53169 641 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C REG1Q00816 1014 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C ATG21Q02887 496 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C RMT2Q03305 412 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C RAD30Q04049 632 aa4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C GET3Q12154 354 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
ATG8YBL078C SPE1P08432 466 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-LR1P0C2J4 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-FP0CX61 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-GR2P0CX62 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YCK1P23291 538 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C PRP22P24384 1145 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C MNE1P24720 663 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-CP25383 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C GPI10P30777 616 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C EFT1P32324 842 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YPT7P32939 208 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C CDS1P38221 457 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C STB5P38699 743 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YIL166CP40445 542 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ARC1P46672 376 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YDL183CP48569 320 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C PSP2P50109 593 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TEL2P53038 688 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C GTF1P53260 183 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C CWC22P53333 577 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ARG5,6Q01217 863 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-DR2Q03483 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C VBA4Q04602 768 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C CTI6Q08923 506 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C NBP2Q12163 236 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-BQ12260 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-OR2Q12293 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C SUL2Q12325 893 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-DR1Q12392 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-OR1Q12439 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY2A-DR3Q99303 438 aa4.58□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TY1B-AO13527 1196 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C CPA2P03965 1118 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C BIK1P11709 440 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C PRP4P20053 465 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C SRO77P38163 1010 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C UTP9P38882 575 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C MSS4P38994 779 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C VFA1P40080 203 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C BIT61P47041 543 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ZAP1P47043 880 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C HOS2P53096 452 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C SGF73P53165 657 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C VPS62P53285 467 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TRS31Q03337 283 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C VPS64Q03944 604 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C PPN1Q04119 674 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C AIM32Q04689 311 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ADY4Q05955 493 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YPL191CQ08930 360 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C SMF3Q12078 473 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C PAR32Q12515 295 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YOL159C-AQ3E769 90 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ECM3Q99252 613 aa4.57□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C RPB2P08518 1224 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ERG20P08524 352 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TUP1P16649 713 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C LCB1P25045 558 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ERG6P25087 383 aaKnown RBP4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YBL029WP38201 376 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C EHT1P38295 451 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YHR112CP38716 378 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C SFB3P38810 929 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C IST3P40565 148 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C LCB2P40970 561 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C SAE2P46946 345 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C TAM41P53230 385 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ASI2P53895 289 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C REC102Q02721 264 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C YAP6Q03935 383 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C VTI1Q04338 217 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C STP3Q05937 343 aa4.56□□□□□ -1.68
ATG8YBL078C ADY3Q07732 790 aa4.56□□□□□ -1.68
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