RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 SptssbQ925E8 76 aa13.84□□□□□ -0.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP13.84□□□□□ -0.19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm4707V9GXN5 68 aa13.83□□□□□ -0.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10065F6TJM2 114 aa13.8□□□□□ -0.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plac8Q9JI48 112 aa13.8□□□□□ -0.2
Nisch-222ENSMUST00000172142 1700042G07RikB1AUF7 90 aa13.77□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah11E9Q7N9 4488 aa13.77□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP13.77□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa13.76□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ndufb1P0DN34 57 aa13.75□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Defb11Q8R2I7 77 aa13.75□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Adm2Q7TNK8 150 aa13.73□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anapc11Q9CPX9 84 aa13.73□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cypt14J3QPF7 87 aa13.72□□□□□ -0.21
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm26620Q9CY65 116 aa13.7□□□□□ -0.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap29-1A2A5X4 342 aa13.7□□□□□ -0.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah9B1AR51 4484 aa13.68□□□□□ -0.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm16253D3Z167 63 aa13.67□□□□□ -0.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm3646F6S692 53 aa13.66□□□□□ -0.22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm9918Q8BUR5 174 aa13.63□□□□□ -0.23
Nisch-222ENSMUST00000172142 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa13.62□□□□□ -0.23
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10643Q3URG9 111 aa13.62□□□□□ -0.23
Nisch-222ENSMUST00000172142 Defb13Q8R2I4 64 aa13.61□□□□□ -0.23
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm21798J3QNU5 87 aa13.58□□□□□ -0.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Defb39Q70KL3 74 aa13.55□□□□□ -0.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa13.55□□□□□ -0.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa13.53□□□□□ -0.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 Limd2Q8BGB5 128 aa13.52□□□□□ -0.24
Nisch-222ENSMUST00000172142 OxtP35454 125 aa13.5□□□□□ -0.25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah5Q8VHE6 4621 aa13.5□□□□□ -0.25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Uqcr11Q9CPX8 56 aa13.47□□□□□ -0.25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cypt15B1AXS0 87 aa13.44□□□□□ -0.26
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa13.4□□□□□ -0.26
Nisch-222ENSMUST00000172142 Tnp2P11378 117 aa13.4□□□□□ -0.26
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap10-4Q08EG8 221 aa13.39□□□□□ -0.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap14O08640 167 aa13.36□□□□□ -0.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa13.36□□□□□ -0.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa13.35□□□□□ -0.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Stard9Q80TF6 4561 aa13.34□□□□□ -0.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Spaca4Q80ZQ0 127 aa13.34□□□□□ -0.27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Vps13dB1ART2 4390 aa13.32□□□□□ -0.28
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10999F6Q4M4 69 aa13.32□□□□□ -0.28
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ndufs5Q99LY9 106 aa13.32□□□□□ -0.28
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wfdc3Q14AE4 130 aa13.31□□□□□ -0.28
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ryr3A2AGL3 4863 aa13.25□□□□□ -0.29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm9821Q8K076 103 aa13.23□□□□□ -0.29
Nisch-222ENSMUST00000172142 Q8BGJ3 129 aa13.18□□□□□ -0.3
Nisch-222ENSMUST00000172142 2310034C09RikQ9D746 214 aa13.16□□□□□ -0.3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap13O88375 197 aa13.13□□□□□ -0.31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Defb1P56386 69 aa13.09□□□□□ -0.31
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah2P0C6F1 4456 aa13.04□□□□□ -0.32
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap10-10A0A1W2P7T6 217 aa13.04□□□□□ -0.32
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm2696A0A1W2P709 240 aa13.01□□□□□ -0.33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pkd1O08852 4293 aa13□□□□□ -0.33
Nisch-222ENSMUST00000172142 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa12.96□□□□□ -0.33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Hectd4E9Q2E4 4418 aa12.96□□□□□ -0.33
Nisch-222ENSMUST00000172142 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa12.9□□□□□ -0.34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa12.9□□□□□ -0.34
Nisch-222ENSMUST00000172142 ApobE9Q414 4505 aa12.88□□□□□ -0.35
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP12.81□□□□□ -0.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ryr1E9PZQ0 5035 aa12.81□□□□□ -0.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap3-2Q9D638 99 aa12.8□□□□□ -0.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa12.8□□□□□ -0.36
Nisch-222ENSMUST00000172142 A930033H14RikG5E8X6 103 aa12.77□□□□□ -0.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pkhd1E9PZ36 4059 aa12.76□□□□□ -0.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lrp1bQ9JI18 4599 aa12.72□□□□□ -0.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa12.72□□□□□ -0.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm4491E0CX42 125 aa12.72□□□□□ -0.37
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm12216A0A1W2P827 62 aa12.66□□□□□ -0.38
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pla2g10Q9QXX3 151 aa12.64□□□□□ -0.39
Nisch-222ENSMUST00000172142 SacsQ9JLC8 4582 aa12.58□□□□□ -0.4
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa12.49□□□□□ -0.41
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rps29P62274 56 aa12.46□□□□□ -0.41
Nisch-222ENSMUST00000172142 RetnlbQ99P86 105 aa12.44□□□□□ -0.42
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fat2Q5F226 4351 aa12.41□□□□□ -0.42
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP12.4□□□□□ -0.42
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm11939A2A592 99 aa12.4□□□□□ -0.42
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cox6b2Q80ZN9 88 aa12.36□□□□□ -0.43
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm20537G3UYK7 97 aa12.35□□□□□ -0.43
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa12.35□□□□□ -0.43
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abca13Q5SSE9 5034 aa12.29□□□□□ -0.44
Nisch-222ENSMUST00000172142 Vps13bQ80TY5 3993 aa12.29□□□□□ -0.44
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa12.2□□□□□ -0.46
Nisch-222ENSMUST00000172142 CriptO70333 101 aa12.1□□□□□ -0.47
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnah8Q91XQ0 4731 aa12.09□□□□□ -0.47
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fat3Q8BNA6 4555 aa12.09□□□□□ -0.47
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa12.08□□□□□ -0.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm9955Q8CEJ8 102 aa12.08□□□□□ -0.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Herc2Q4U2R1 4836 aa12.06□□□□□ -0.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mp68P56379 58 aa12.04□□□□□ -0.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm20538F6Z9R1 75 aa12.03□□□□□ -0.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa12.03□□□□□ -0.48
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm17606F6ZL36 78 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 HydinQ80W93 5154 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Romo1P60603 79 aa12.01□□□□□ -0.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa12□□□□□ -0.49
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm10382Q3V0T5 144 aa11.96□□□□□ -0.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rnase13Q5GAM7 153 aa11.91□□□□□ -0.5
Nisch-222ENSMUST00000172142 Krtap19-5O08632 62 aa11.89□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 98.5 ms