RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000172142.7

Nisch-222, Transcript of Nischarin, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nisch, Length 2,780 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nisch-222ENSMUST00000172142 NischQ80TM9 1593 aa42,56■■■■■ 4,4
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm35339A0A140LHH9 1649 aa42,28■■■■■ 4,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc9P70170 1546 aa41,2■■■■■ 4,19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Abcc8B2RUS7 1588 aa40,72■■■■■ 4,11
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rhox8Q6VSS7 320 aa40,17■■■■■ 4,02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rtl1Q7M732 1744 aa39,78■■■■□ 3,96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc180J3QNE4 1664 aa39,26■■■■□ 3,88
Nisch-222ENSMUST00000172142 ScribQ80U72 1612 aa38,76■■■■□ 3,8
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rpgrip1Q9EPQ2 1331 aa38,53■■■■□ 3,76
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zcchc6Q5BLK4 1491 aaKnown RBP38,12■■■■□ 3,69
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kdm5dQ62240 1548 aa37,7■■■■□ 3,63
Nisch-222ENSMUST00000172142 Acin1Q9JIX8 1338 aaKnown RBP37,61■■■■□ 3,61
Nisch-222ENSMUST00000172142 HrcG5E8J6 738 aa37,44■■■■□ 3,58
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dcaf1Q80TR8 1506 aa37,42■■■■□ 3,58
Nisch-222ENSMUST00000172142 NacadQ5SWP3 1504 aa37,36■■■■□ 3,57
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rb1cc1Q9ESK9 1588 aa37,24■■■■□ 3,55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ehmt2Q9Z148 1263 aaKnown RBP37,21■■■■□ 3,55
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc136Q3TVA9 1136 aa37,13■■■■□ 3,54
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sycp2Q9CUU3 1500 aa36,65■■■■□ 3,46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Baz1aO88379 1555 aa36,64■■■■□ 3,46
Nisch-222ENSMUST00000172142 Trim41Q5NCC3 630 aa36,6■■■■□ 3,45
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pcgf6Q99NA9 353 aa36,42■■■■□ 3,42
Nisch-222ENSMUST00000172142 BicraF8VPZ9 1578 aa36,16■■■■□ 3,38
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cep164Q5DU05 1446 aa36,07■■■■□ 3,36
Nisch-222ENSMUST00000172142 Crybg2B7ZCC2 1516 aa35,92■■■■□ 3,34
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smarca2Q6DIC0 1577 aa35,83■■■■□ 3,33
Nisch-222ENSMUST00000172142 Supt5hO55201 1082 aaKnown RBP35,66■■■■□ 3,3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cngb1E1AZ71 1325 aa35,49■■■■□ 3,27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cecr2E9Q2Z1 1453 aa35,45■■■■□ 3,27
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gab3Q8BSM5 595 aa35,4■■■■□ 3,26
Nisch-222ENSMUST00000172142 Chic1Q8CBW7 227 aa35,37■■■■□ 3,25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rsf1E9PWW9 1441 aaKnown RBP35,35■■■■□ 3,25
Nisch-222ENSMUST00000172142 Brd4Q9ESU6 1400 aaKnown RBP35,19■■■■□ 3,22
Nisch-222ENSMUST00000172142 NefmP08553 848 aa35,18■■■■□ 3,22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Zeb1Q64318 1117 aa35,14■■■■□ 3,22
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc88bQ4QRL3 1481 aa35■■■■□ 3,19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Mier1Q5UAK0 511 aa35■■■■□ 3,19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Golga3P55937 1487 aa34,99■■■■□ 3,19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Neurod1Q60867 357 aa34,96■■■■□ 3,19
Nisch-222ENSMUST00000172142 Smarca4Q3TKT4 1613 aaKnown RBP34,82■■■■□ 3,16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Synj1Q8CHC4 1574 aa34,82■■■■□ 3,16
Nisch-222ENSMUST00000172142 Esf1Q3V1V3 845 aaKnown RBP34,71■■■■□ 3,15
Nisch-222ENSMUST00000172142 Sall2Q9QX96 1004 aa34,62■■■■□ 3,13
Nisch-222ENSMUST00000172142 CftrP26361 1476 aa34,61■■■■□ 3,13
Nisch-222ENSMUST00000172142 Iqgap2Q3UQ44 1575 aa34,55■■■■□ 3,12
Nisch-222ENSMUST00000172142 Pds5bQ4VA53 1446 aaKnown RBP34,53■■■■□ 3,12
Nisch-222ENSMUST00000172142 Atad2bE9Q166 1460 aaKnown RBP34,53■■■■□ 3,12
Nisch-222ENSMUST00000172142 Las1lA2BE28 776 aaKnown RBP34,51■■■■□ 3,11
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cttnbp2B9EJA2 1648 aa34,45■■■■□ 3,1
Nisch-222ENSMUST00000172142 UbtfP25976 765 aaKnown RBP34,36■■■■□ 3,09
Nisch-222ENSMUST00000172142 Top2bQ64511 1612 aa34,35■■■■□ 3,09
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr66E9Q743 1299 aa34,22■■■■□ 3,07
Nisch-222ENSMUST00000172142 Anks4bQ8K3X6 423 aa34,16■■■■□ 3,06
Nisch-222ENSMUST00000172142 Rapgef2Q8CHG7 1496 aa34,11■■■■□ 3,05
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cc2d2aQ8CFW7 1633 aa34,06■■■■□ 3,04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Frmpd1A2AKB4 1549 aa34,05■■■■□ 3,04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP34,02■■■■□ 3,04
Nisch-222ENSMUST00000172142 Wdr62Q3U3T8 1523 aa34■■■■□ 3,03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Myt1lP97500 1187 aa33,99■■■■□ 3,03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ercc6F8VPZ5 1481 aa33,96■■■■□ 3,03
Nisch-222ENSMUST00000172142 Thoc2B1AZI6 1594 aaKnown RBP33,95■■■■□ 3,02
Nisch-222ENSMUST00000172142 ClspnQ80YR7 1315 aa33,93■■■■□ 3,02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fmn1Q05860 1466 aa33,93■■■■□ 3,02
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cep162Q6ZQ06 1403 aa33,87■■■■□ 3,01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Dnajc5bQ9CQ94 199 aa33,87■■■■□ 3,01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cdk11bP24788 784 aaKnown RBP33,87■■■■□ 3,01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Top2aQ01320 1528 aaKnown RBP33,83■■■■□ 3,01
Nisch-222ENSMUST00000172142 Unc13aQ4KUS2 1712 aa33,82■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Csrnp3P59055 597 aa33,82■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Nop58Q6DFW4 536 aaKnown RBP33,81■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 1700123L14RikQ3V2K7 440 aa33,78■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 Npm2Q80W85 207 aa33,77■■■■□ 3
Nisch-222ENSMUST00000172142 TonslQ6NZL6 1363 aa33,75■■■□□ 2,99
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ppargc1bQ8VHJ7 1014 aa33,65■■■□□ 2,98
Nisch-222ENSMUST00000172142 Clip1Q922J3 1391 aa33,61■■■□□ 2,97
Nisch-222ENSMUST00000172142 Plekhg3Q4VAC9 1341 aa33,55■■■□□ 2,96
Nisch-222ENSMUST00000172142 Aplp2Q06335 707 aa33,41■■■□□ 2,94
Nisch-222ENSMUST00000172142 Phldb1Q6PDH0 1371 aaKnown RBP33,38■■■□□ 2,93
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ncapd3Q6ZQK0 1506 aa33,34■■■□□ 2,93
Nisch-222ENSMUST00000172142 Fam135aQ6NS59 1506 aa33,33■■■□□ 2,93
Nisch-222ENSMUST00000172142 Kif15Q6P9L6 1387 aa33,32■■■□□ 2,92
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ubl4bQ9CQ84 188 aa33,31■■■□□ 2,92
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eif4g1Q6NZJ6 1600 aaKnown RBP33,28■■■□□ 2,92
Nisch-222ENSMUST00000172142 CenpbP27790 599 aa33,23■■■□□ 2,91
Nisch-222ENSMUST00000172142 Il27Q8K3I6 234 aa33,2■■■□□ 2,91
Nisch-222ENSMUST00000172142 Lamc3Q9R0B6 1581 aa33,2■■■□□ 2,9
Nisch-222ENSMUST00000172142 TnnQ80Z71 1560 aa33,19■■■□□ 2,9
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eea1Q8BL66 1411 aa33,08■■■□□ 2,89
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arhgap35Q91YM2 1499 aa33,07■■■□□ 2,88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ap3b1Q9Z1T1 1105 aa33,02■■■□□ 2,88
Nisch-222ENSMUST00000172142 Eid3Q3V124 375 aa32,99■■■□□ 2,87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Cux2P70298 1426 aa32,99■■■□□ 2,87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Myt1Q8CFC2 1127 aa32,97■■■□□ 2,87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Arap1Q4LDD4 1452 aa32,96■■■□□ 2,87
Nisch-222ENSMUST00000172142 Setd5Q5XJV7 1441 aa32,92■■■□□ 2,86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Gm38655A0A286YDK6 273 aa32,91■■■□□ 2,86
Nisch-222ENSMUST00000172142 PtprkP35822 1457 aa32,9■■■□□ 2,86
Nisch-222ENSMUST00000172142 NrkQ9R0G8 1455 aa32,9■■■□□ 2,86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Ccdc18Q640L5 1455 aa32,89■■■□□ 2,86
Nisch-222ENSMUST00000172142 Camsap1A2AHC3 1581 aa32,88■■■□□ 2,85
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