Protein–RNA interactions for Protein: A2A5X4

Krtap29-1, Keratin-associated protein 29-1, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap29-1A2A5X4 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC23,96■■□□□ 1,43
Krtap29-1A2A5X4 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC22,07■■□□□ 1,12
Krtap29-1A2A5X4 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,8■■□□□ 1,08
Krtap29-1A2A5X4 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21,3■■□□□ 1
Krtap29-1A2A5X4 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC21,11■□□□□ 0,97
Krtap29-1A2A5X4 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,86■□□□□ 0,93
Krtap29-1A2A5X4 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC20,7■□□□□ 0,9
Krtap29-1A2A5X4 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC20,67■□□□□ 0,9
Krtap29-1A2A5X4 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,62■□□□□ 0,89
Krtap29-1A2A5X4 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Krtap29-1A2A5X4 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,23■□□□□ 0,83
Krtap29-1A2A5X4 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20,08■□□□□ 0,81
Krtap29-1A2A5X4 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC20,06■□□□□ 0,8
Krtap29-1A2A5X4 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,04■□□□□ 0,8
Krtap29-1A2A5X4 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,94■□□□□ 0,78
Krtap29-1A2A5X4 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC19,82■□□□□ 0,76
Krtap29-1A2A5X4 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,68■□□□□ 0,74
Krtap29-1A2A5X4 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC19,66■□□□□ 0,74
Krtap29-1A2A5X4 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Krtap29-1A2A5X4 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,65■□□□□ 0,74
Krtap29-1A2A5X4 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,57■□□□□ 0,72
Krtap29-1A2A5X4 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,55■□□□□ 0,72
Krtap29-1A2A5X4 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Krtap29-1A2A5X4 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,46■□□□□ 0,71
Krtap29-1A2A5X4 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,44■□□□□ 0,7
Krtap29-1A2A5X4 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Krtap29-1A2A5X4 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC19,4■□□□□ 0,7
Krtap29-1A2A5X4 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19,34■□□□□ 0,69
Krtap29-1A2A5X4 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Krtap29-1A2A5X4 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Krtap29-1A2A5X4 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC19,13■□□□□ 0,65
Krtap29-1A2A5X4 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC19,09■□□□□ 0,65
Krtap29-1A2A5X4 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Krtap29-1A2A5X4 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0,63
Krtap29-1A2A5X4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Krtap29-1A2A5X4 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Krtap29-1A2A5X4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,92■□□□□ 0,62
Krtap29-1A2A5X4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Krtap29-1A2A5X4 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,88■□□□□ 0,61
Krtap29-1A2A5X4 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18,85■□□□□ 0,61
Krtap29-1A2A5X4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18,85■□□□□ 0,61
Krtap29-1A2A5X4 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC18,77■□□□□ 0,6
Krtap29-1A2A5X4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,67■□□□□ 0,58
Krtap29-1A2A5X4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Krtap29-1A2A5X4 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,64■□□□□ 0,57
Krtap29-1A2A5X4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,6■□□□□ 0,57
Krtap29-1A2A5X4 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,59■□□□□ 0,57
Krtap29-1A2A5X4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,58■□□□□ 0,56
Krtap29-1A2A5X4 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18,55■□□□□ 0,56
Krtap29-1A2A5X4 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC18,54■□□□□ 0,56
Krtap29-1A2A5X4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC18,53■□□□□ 0,56
Krtap29-1A2A5X4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18,52■□□□□ 0,56
Krtap29-1A2A5X4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,46■□□□□ 0,55
Krtap29-1A2A5X4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC18,44■□□□□ 0,54
Krtap29-1A2A5X4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,36■□□□□ 0,53
Krtap29-1A2A5X4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC18,35■□□□□ 0,53
Krtap29-1A2A5X4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18,35■□□□□ 0,53
Krtap29-1A2A5X4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18,34■□□□□ 0,53
Krtap29-1A2A5X4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC18,34■□□□□ 0,53
Krtap29-1A2A5X4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Krtap29-1A2A5X4 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18,28■□□□□ 0,52
Krtap29-1A2A5X4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,28■□□□□ 0,52
Krtap29-1A2A5X4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,27■□□□□ 0,52
Krtap29-1A2A5X4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18,27■□□□□ 0,52
Krtap29-1A2A5X4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,25■□□□□ 0,51
Krtap29-1A2A5X4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,24■□□□□ 0,51
Krtap29-1A2A5X4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,24■□□□□ 0,51
Krtap29-1A2A5X4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Krtap29-1A2A5X4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,23■□□□□ 0,51
Krtap29-1A2A5X4 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,21■□□□□ 0,51
Krtap29-1A2A5X4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18,2■□□□□ 0,5
Krtap29-1A2A5X4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,16■□□□□ 0,5
Krtap29-1A2A5X4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,14■□□□□ 0,49
Krtap29-1A2A5X4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18,1■□□□□ 0,49
Krtap29-1A2A5X4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,08■□□□□ 0,48
Krtap29-1A2A5X4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,06■□□□□ 0,48
Krtap29-1A2A5X4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18,05■□□□□ 0,48
Krtap29-1A2A5X4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,04■□□□□ 0,48
Krtap29-1A2A5X4 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,03■□□□□ 0,48
Krtap29-1A2A5X4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18,02■□□□□ 0,48
Krtap29-1A2A5X4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC18,02■□□□□ 0,47
Krtap29-1A2A5X4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC18■□□□□ 0,47
Krtap29-1A2A5X4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,94■□□□□ 0,46
Krtap29-1A2A5X4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17,91■□□□□ 0,46
Krtap29-1A2A5X4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,9■□□□□ 0,46
Krtap29-1A2A5X4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,89■□□□□ 0,45
Krtap29-1A2A5X4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17,87■□□□□ 0,45
Krtap29-1A2A5X4 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,85■□□□□ 0,45
Krtap29-1A2A5X4 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17,83■□□□□ 0,44
Krtap29-1A2A5X4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17,82■□□□□ 0,44
Krtap29-1A2A5X4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17,81■□□□□ 0,44
Krtap29-1A2A5X4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17,79■□□□□ 0,44
Krtap29-1A2A5X4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,77■□□□□ 0,44
Krtap29-1A2A5X4 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,72■□□□□ 0,43
Krtap29-1A2A5X4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,71■□□□□ 0,43
Krtap29-1A2A5X4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Krtap29-1A2A5X4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Krtap29-1A2A5X4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17,7■□□□□ 0,42
Krtap29-1A2A5X4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Krtap29-1A2A5X4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,69■□□□□ 0,42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms