RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rps28P62858 69 aaKnown RBP13.93□□□□□ -0.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb39Q70KL3 74 aa13.93□□□□□ -0.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ryr1E9PZQ0 5035 aa13.92□□□□□ -0.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Samd13D3YUG0 102 aa13.91□□□□□ -0.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SacsQ9JLC8 4582 aa13.9□□□□□ -0.18
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smlr1J3QMJ4 66 aa13.88□□□□□ -0.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A0A286YE49 62 aa13.85□□□□□ -0.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm2310J3QNJ2 377 aa13.84□□□□□ -0.19
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrp1bQ9JI18 4599 aa13.78□□□□□ -0.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Coa6Q8BGD8 79 aa13.78□□□□□ -0.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bean1Q9EQG5 255 aa13.78□□□□□ -0.2
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm16253D3Z167 63 aa13.77□□□□□ -0.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pet100P0DJE0 76 aa13.73□□□□□ -0.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Anapc11Q9CPX9 84 aa13.72□□□□□ -0.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spint4Q9D263 159 aa13.72□□□□□ -0.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hectd4E9Q2E4 4418 aa13.72□□□□□ -0.21
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Atox1O08997 68 aaKnown RBP13.7□□□□□ -0.22
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SnurfQ9WU12 71 aa13.7□□□□□ -0.22
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Serp1Q9Z1W5 66 aa13.67□□□□□ -0.22
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa13.67□□□□□ -0.22
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 RetnlbQ99P86 105 aa13.64□□□□□ -0.23
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 1700074P13RikQ9D9G7 251 aa13.64□□□□□ -0.23
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa13.63□□□□□ -0.23
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fat2Q5F226 4351 aa13.58□□□□□ -0.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mrpl55Q9CZ83 127 aa13.58□□□□□ -0.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Brk1Q91VR8 75 aa13.57□□□□□ -0.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnah8Q91XQ0 4731 aa13.57□□□□□ -0.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vps13bQ80TY5 3993 aa13.55□□□□□ -0.24
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap19-5O08632 62 aa13.5□□□□□ -0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Coa5Q99M07 74 aa13.48□□□□□ -0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb12Q8K4N3 78 aa13.46□□□□□ -0.25
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cdc42se1Q8BHL7 80 aa13.45□□□□□ -0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 H2al1aQ5M8Q2 105 aa13.42□□□□□ -0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10267M0QWD8 85 aa13.41□□□□□ -0.26
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Chtf8P0CG14 533 aa13.39□□□□□ -0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Spaca4Q80ZQ0 127 aa13.38□□□□□ -0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cypt15B1AXS0 87 aa13.37□□□□□ -0.27
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dph3Q8K0W9 82 aa13.33□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A530084C06RikQ3UTW2 186 aa13.32□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP13.32□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fat3Q8BNA6 4555 aa13.31□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Herc2Q4U2R1 4836 aa13.3□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abca13Q5SSE9 5034 aa13.3□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10160F6Y577 67 aa13.28□□□□□ -0.28
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Birc6O88738 4882 aa13.26□□□□□ -0.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb13Q8R2I4 64 aa13.25□□□□□ -0.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10197F6QEY5 67 aa13.23□□□□□ -0.29
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa13.19□□□□□ -0.3
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10643Q3URG9 111 aa13.12□□□□□ -0.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa13.11□□□□□ -0.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rps29P62274 56 aa13.1□□□□□ -0.31
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa13.07□□□□□ -0.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Phxr4P15974 95 aa13.06□□□□□ -0.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb38Q7TNV7 63 aa13.05□□□□□ -0.32
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10337F7DEP7 55 aa13□□□□□ -0.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21798J3QNU5 87 aa12.96□□□□□ -0.33
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa12.95□□□□□ -0.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 HydinQ80W93 5154 aa12.92□□□□□ -0.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm26620Q9CY65 116 aa12.91□□□□□ -0.34
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 H2al1bA0A087WP11 105 aa12.89□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 H2al1kJ3QP08 105 aa12.89□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 H2al1eQ810S6 105 aa12.89□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 H2al1mQ9DAD9 105 aa12.89□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa12.88□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm20661K7N787 53 aa12.85□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap3-2Q9D638 99 aa12.85□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa12.85□□□□□ -0.35
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm10999F6Q4M4 69 aa12.79□□□□□ -0.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sox16Q62247 57 aa12.78□□□□□ -0.36
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PcloQ9QYX7 5068 aa12.77□□□□□ -0.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm11939A2A592 99 aa12.76□□□□□ -0.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q8BGJ3 129 aa12.74□□□□□ -0.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 A930033H14RikG5E8X6 103 aa12.73□□□□□ -0.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2310034C09RikQ9D746 214 aa12.71□□□□□ -0.37
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lce1mQ9CR91 182 aa12.71□□□□□ -0.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ndufb1P0DN34 57 aa12.68□□□□□ -0.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa12.68□□□□□ -0.38
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4933415A04RikQ9D443 101 aa12.64□□□□□ -0.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Limd2Q8BGB5 128 aa12.62□□□□□ -0.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uqcr11Q9CPX8 56 aa12.62□□□□□ -0.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5965D3Z724 196 aa12.59□□□□□ -0.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa12.59□□□□□ -0.39
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm4491E0CX42 125 aa12.57□□□□□ -0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Lrp2A2ARV4 4660 aa12.57□□□□□ -0.4
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa12.5□□□□□ -0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 SptssbQ925E8 76 aa12.47□□□□□ -0.41
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Herc1E9PZP8 4859 aa12.35□□□□□ -0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Defb1P56386 69 aa12.34□□□□□ -0.43
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 9230102O04RikA2ASX7 82 aa12.29□□□□□ -0.44
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Krtap15-1Q9QZU5 150 aa12.23□□□□□ -0.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm18596A0A1W2P860 280 aa12.21□□□□□ -0.45
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm9821Q8K076 103 aa12.19□□□□□ -0.46
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rpl37Q9D823 97 aa12.16□□□□□ -0.46
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rnase13Q5GAM7 153 aa12.1□□□□□ -0.47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cox6b2Q80ZN9 88 aa12.09□□□□□ -0.47
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm3646F6S692 53 aa12.07□□□□□ -0.48
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sec61gP60060 68 aa12.07□□□□□ -0.48
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm17416Q30KP4 66 aa11.94□□□□□ -0.5
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ush2AQ2QI47 5193 aa11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 92.1 ms