RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap13O88375 197 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 OxtP35454 125 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10642Q3TWM1 71 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc10Q3V2J9 124 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adm2Q7TNK8 150 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10139O88245 57 aa7.75□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb38Q7TNV7 63 aa7.74□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap29-1A2A5X4 342 aa7.73□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chtf8P0CG14 533 aa7.73□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnah2P0C6F1 4456 aa7.72□□□□□ -1.17
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Chchd10Q7TNL9 138 aa7.69□□□□□ -1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ApobE9Q414 4505 aa7.68□□□□□ -1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anapc11Q9CPX9 84 aa7.66□□□□□ -1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fat1A0A1L1SQU7 4645 aa7.66□□□□□ -1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm2310J3QNJ2 377 aa7.65□□□□□ -1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phxr4P15974 95 aa7.65□□□□□ -1.18
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4933415A04RikQ9D443 101 aa7.65□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp1bQ9JI18 4599 aa7.64□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa7.63□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap14O08640 167 aa7.63□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa7.62□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa7.62□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm27235Q3UW50 83 aa7.62□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hectd4E9Q2E4 4418 aa7.61□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dync1h1Q9JHU4 4644 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10160F6Y577 67 aa7.58□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkhd1E9PZ36 4059 aa7.57□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20604F8WIA3 75 aa7.56□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Igkv3-3A0A140T8Q0 119 aa7.55□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tnp2P11378 117 aa7.53□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8K1L6 76 aa7.53□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sox16Q62247 57 aa7.53□□□□□ -1.2
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ryr2E9Q401 4966 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm20661K7N787 53 aa7.51□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1Y7VJH8 109 aa7.51□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 9230102O04RikA2ASX7 82 aa7.5□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ryr1E9PZQ0 5035 aa7.49□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SptssbQ925E8 76 aa7.49□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb39Q70KL3 74 aa7.48□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wfdc3Q14AE4 130 aa7.46□□□□□ -1.21
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RetnlbQ99P86 105 aa7.45□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sec61gP60060 68 aa7.45□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc179J3QM76 67 aa7.43□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm21798J3QNU5 87 aa7.42□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp1Q91ZX7 4545 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fat2Q5F226 4351 aa7.41□□□□□ -1.22
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kmt2cQ8BRH4 4903 aa7.4□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cypt14J3QPF7 87 aa7.4□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SacsQ9JLC8 4582 aa7.4□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Spaca4Q80ZQ0 127 aa7.38□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm16253D3Z167 63 aa7.37□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3646F6S692 53 aa7.37□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb13Q8R2I4 64 aa7.37□□□□□ -1.23
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufb1P0DN34 57 aa7.32□□□□□ -1.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm26620Q9CY65 116 aa7.3□□□□□ -1.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 1700042G07RikB1AUF7 90 aa7.3□□□□□ -1.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Abca13Q5SSE9 5034 aa7.29□□□□□ -1.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vps13bQ80TY5 3993 aa7.28□□□□□ -1.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pkhd1l1Q80ZA4 4249 aa7.27□□□□□ -1.24
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cypt15B1AXS0 87 aa7.27□□□□□ -1.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10999F6Q4M4 69 aa7.25□□□□□ -1.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndufs5Q99LY9 106 aa7.25□□□□□ -1.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm10643Q3URG9 111 aa7.22□□□□□ -1.25
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap28-10A0A1Y7VP58 119 aa7.21□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Defb1P56386 69 aa7.21□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Limd2Q8BGB5 128 aa7.2□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uqcr11Q9CPX8 56 aa7.2□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mycbp2Q7TPH6 4711 aa7.17□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fat3Q8BNA6 4555 aa7.17□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q8BGJ3 129 aa7.16□□□□□ -1.26
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2310034C09RikQ9D746 214 aa7.14□□□□□ -1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap19-5O08632 62 aa7.14□□□□□ -1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnah8Q91XQ0 4731 aa7.13□□□□□ -1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Herc2Q4U2R1 4836 aa7.11□□□□□ -1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HydinQ80W93 5154 aa7.1□□□□□ -1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa1109A2AAE1 5005 aa7.09□□□□□ -1.27
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9736A0A1W2P7N1 277 aa7.08□□□□□ -1.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm9821Q8K076 103 aa7.04□□□□□ -1.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2310079G19RikQ9D6L6 185 aa7.04□□□□□ -1.28
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PcloQ9QYX7 5068 aa6.98□□□□□ -1.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap3-2Q9D638 99 aa6.98□□□□□ -1.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krtap3-3Q9D7P0 99 aa6.98□□□□□ -1.29
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Birc6O88738 4882 aa6.91□□□□□ -1.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm11939A2A592 99 aa6.9□□□□□ -1.3
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 D6Ertd527eA0A0N4SWI3 464 aa6.9□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4930507D05RikQ8C9C9 103 aa6.9□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm4491E0CX42 125 aa6.89□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrp2A2ARV4 4660 aa6.87□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5965D3Z724 196 aa6.87□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnhd1D3Z2X2 4750 aa6.87□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A930033H14RikG5E8X6 103 aa6.87□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps29P62274 56 aa6.85□□□□□ -1.31
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A030005L19RikA0A1Y7VIU2 113 aa6.84□□□□□ -1.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 A0A1Y7VLE6 161 aa6.83□□□□□ -1.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7544A0A1Y7VJ58 118 aa6.81□□□□□ -1.32
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pla2g10Q9QXX3 151 aa6.76□□□□□ -1.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3880A0A1B0GSB3 72 aa6.75□□□□□ -1.33
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5767A0A0J9YTU8 78 aa6.75□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 14.7 ms