RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000017530.3

Traf4-201, Transcript of TNF receptor-associated factor 4, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Traf4, Length 2,078 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Exosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf4-201ENSMUST00000017530 PlecQ9QXS1 4691 aaKnown RBP15,88■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igkv1-110A0A0B4J1I0 119 aa15,86■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10401E9Q3K6 71 aa15,86■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 Phf5aP83870 110 aaKnown RBP15,85■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm9918Q8BUR5 174 aa15,85■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 D130052B06RikQ3UW13 202 aa15,85■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 PkigO70139 76 aa15,83■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 1700012A03RikQ9DAF1 130 aa15,83■□□□□ 0,13
Traf4-201ENSMUST00000017530 Plac8Q9JI48 112 aa15,83■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam229bQ8CF36 80 aa15,82■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm28539A0A087WSL9 92 aa15,82■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Defa28D3Z1V9 94 aa15,82■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Defb11Q8R2I7 77 aa15,82■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm17521F6QAC8 156 aa15,8■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Naa38Q9D2U5 125 aa15,8■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Defa7P50705 93 aa15,79■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Serp2Q6TAW2 65 aa15,79■□□□□ 0,12
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10139O88245 57 aa15,76■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 4930518I15RikQ3V2W7 57 aa15,76■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 FcgbpE9Q0B5 2583 aa15,76■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 Wfdc10Q3V2J9 124 aa15,75■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 Defb9Q8R2I6 67 aa15,74■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 Wfdc13Q5DQQ6 81 aa15,73■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 C130032M10RikQ8C888 123 aa15,72■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 1700018G05RikA0A1B0GSI2 66 aa15,71■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 Fam19a3Q7TPG6 132 aa15,71■□□□□ 0,11
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm12353A2AGJ4 60 aa15,71■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igkv3-4A0A140T8Q4 119 aa15,7■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 Mrpl34Q99N91 92 aa15,7■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 SmcpP15265 143 aa15,69■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm44790A0A0N4SV91 103 aa15,68■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10065F6TJM2 114 aa15,68■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 AI606181Q8C7B9 129 aa15,68■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm20726G3UX18 150 aa15,67■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ndufc1Q9CQY9 76 aa15,66■□□□□ 0,1
Traf4-201ENSMUST00000017530 HrnrQ8VHD8 2496 aa15,64■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 6030445D17RikE9Q8F9 148 aa15,64■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Odf3bQ5M8M2 238 aa15,64■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm37013Q8K491 104 aa15,64■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Q8BT88 171 aa15,63■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Defa21Q8C1P2 93 aa15,62■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 FasnP19096 2504 aaKnown RBP15,62■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap29-1A2A5X4 342 aa15,61■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa15,61■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ube2aQ9Z255 152 aa15,6■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10570F6VB42 170 aa15,59■□□□□ 0,09
Traf4-201ENSMUST00000017530 Smim20D3Z7Q2 69 aa15,57■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ly6g6cQ9Z1Q4 126 aa15,57■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Prr15lQ8JZM2 100 aa15,56■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 UqcrqQ9CQ69 82 aa15,56■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igkv3-7A0A0G2JE31 119 aa15,54■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 GhrhP16043 103 aa15,54■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm27235Q3UW50 83 aa15,53■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Chchd10Q7TNL9 138 aa15,53■□□□□ 0,08
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm28230A0A0A0MQ91 144 aa15,52■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igkv3-10A0A0G2JGN0 119 aa15,51■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Q8K1L6 76 aa15,51■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm21886J3QJU9 214 aa15,5■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm10642Q3TWM1 71 aa15,5■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igkv8-19A0A0G2JFN8 121 aa15,5■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Scgb1b2O35176 93 aa15,5■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 B230307C23RikQ8BLB2 64 aa15,5■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dnah7aE9Q0T8 4024 aa15,48■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Igkv3-5A0A140T8M6 119 aa15,47■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dnah7cA0A087WR13 4024 aa15,47■□□□□ 0,07
Traf4-201ENSMUST00000017530 BikO70337 150 aa15,43■□□□□ 0,06
Traf4-201ENSMUST00000017530 Adm2Q7TNK8 150 aa15,39■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 NbdyA0A0N4SUI7 68 aa15,39■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 1600014C23RikQ9DAX4 101 aa15,39■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dnah5Q8VHE6 4621 aa15,38■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap10-4Q08EG8 221 aa15,37■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tmem258P61166 79 aa15,36■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 Spink8Q09TK9 105 aa15,36■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 Reg3aO09037 175 aa15,35■□□□□ 0,05
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gpr15lA0A0B4J1N3 78 aa15,31■□□□□ 0,04
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm19935A0A1B0GSF9 52 aa15,26■□□□□ 0,03
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm20604F8WIA3 75 aa15,24■□□□□ 0,03
Traf4-201ENSMUST00000017530 Tnp2P11378 117 aa15,24■□□□□ 0,03
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rpl37aP61514 92 aa15,24■□□□□ 0,03
Traf4-201ENSMUST00000017530 Samd13D3YUG0 102 aa15,22■□□□□ 0,03
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap14O08640 167 aa15,21■□□□□ 0,03
Traf4-201ENSMUST00000017530 Vps13dB1ART2 4390 aa15,2■□□□□ 0,02
Traf4-201ENSMUST00000017530 Anapc11Q9CPX9 84 aa15,19■□□□□ 0,02
Traf4-201ENSMUST00000017530 Znf706Q9D115 76 aaKnown RBP15,19■□□□□ 0,02
Traf4-201ENSMUST00000017530 Cypt14J3QPF7 87 aa15,16■□□□□ 0,02
Traf4-201ENSMUST00000017530 Defb39Q70KL3 74 aa15,16■□□□□ 0,02
Traf4-201ENSMUST00000017530 A0A286YE49 62 aa15,13■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 Rps28P62858 69 aaKnown RBP15,12■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 Dnah2P0C6F1 4456 aa15,11■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm28374F6SG70 93 aa15,1■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 Ccdc179J3QM76 67 aa15,1■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 Gm2310J3QNJ2 377 aa15,1■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 SnurfQ9WU12 71 aa15,1■□□□□ 0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 Pkd1O08852 4293 aa15,07■□□□□ 0
Traf4-201ENSMUST00000017530 Hectd4E9Q2E4 4418 aa15,05■□□□□ -0
Traf4-201ENSMUST00000017530 Krtap13O88375 197 aa15,04■□□□□ -0
Traf4-201ENSMUST00000017530 Coa6Q8BGD8 79 aa15,04■□□□□ -0
Traf4-201ENSMUST00000017530 Smlr1J3QMJ4 66 aa15,02□□□□□ -0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 ApobE9Q414 4505 aa15,01□□□□□ -0,01
Traf4-201ENSMUST00000017530 OxtP35454 125 aa15,01□□□□□ -0,01
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 10,1 ms