RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000107060.7

Eftud2-202, Transcript of 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Eftud2, Length 3,339 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrygfQ9CXV3 174 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 HilpdaQ9JLS0 64 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Pla2g1bQ9Z0Y2 146 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01745 121 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prelid3aQ8VE85 172 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav13d-1A0A075B606 110 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Fam240bJ3QMB3 78 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-61P01749 117 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9936Q8C864 160 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 MobpQ9D2P8 170 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Wnk1P83741 2377 aa10.48□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrygdP04342 174 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CrygeQ03740 174 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930432M17RikQ3V0W9 174 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Psors1c2Q80ZC9 134 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10542F6XDR3 90 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 P01823 113 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CckP09240 115 aa10.47□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-61A0A0G2JH00 117 aa10.46□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hint1P70349 126 aaKnown RBP10.46□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rmi2Q3UPE3 149 aa10.46□□□□□ -0.73
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-62-1A0A075B5U3 116 aa10.46□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tcf24V9GWT9 166 aa10.46□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm20730A0A075B5J6 119 aa10.45□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 9430069I07RikQ9CX21 111 aa10.45□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm26920S4R2A5 56 aa10.45□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ociad2Q9D8W7 154 aa10.45□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox7a1P56392 80 aa10.44□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfp951A0A087WRH0 451 aa10.44□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm9513B3GLJ6 99 aa10.44□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Spink1P09036 80 aa10.44□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ppp1r32Q148A4 427 aa10.43□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 BC048562Q80ZQ7 204 aa10.43□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gtf2h5Q8K2X8 71 aa10.43□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Try10Q792Z1 246 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700010B08RikQ9DAI7 102 aa10.43□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa3P28310 93 aa10.42□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa10P50708 93 aa10.42□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defa15P50713 93 aa10.42□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cmc4Q61908 68 aa10.42□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Setd2E9Q5F9 2537 aa10.42□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-54A0A0G2JES9 117 aa10.41□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Atp6v0e2Q91XE7 81 aa10.41□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Igkv4-53A0A0G2JFC6 119 aa10.41□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Scgb1b24B1B0N6 92 aa10.41□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl32-psP17932 135 aa10.41□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-49A0A0A6YWX2 117 aa10.4□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 NrepQ07475 68 aa10.4□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ighv1-59A0A0A6YXE0 117 aa10.4□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Glrp1E9Q9S8 174 aa10.4□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Q8R092 253 aa10.4□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rab37Q9JKM7 223 aa10.4□□□□□ -0.74
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Kmt2aP55200 3966 aa10.39□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sh2d1aO88890 126 aa10.39□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Odf3l2Q3TZ65 277 aa10.39□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm11444F6QMA6 170 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Foxc1Q61572 553 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sprr1bQ62267 153 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Hrct1Q9D6B9 109 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zfand2aQ9JII7 171 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tenm1Q9WTS4 2731 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Esm1Q9QYY7 184 aa10.38□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb50Q6TU36 73 aa10.37□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm7257D3YX25 99 aa10.37□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Sostdc1Q9CQN4 206 aa10.37□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 D730001G18RikA0A087WQU7 115 aa10.36□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10577Q3UDV9 132 aa10.36□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CirbpP60824 172 aaKnown RBP10.35□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10135F6TEE5 83 aa10.35□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 4930415O20RikQ8CDT5 131 aa10.35□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Zc2hc1bQ9D534 172 aa10.35□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav13n-1A0A0G2JEU8 110 aa10.34□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Nbeal2Q6ZQA0 2742 aa10.34□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav11A0A0B4J1J9 114 aa10.34□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 RetnQ99P87 114 aa10.34□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Ss18l2Q9D174 77 aa10.34□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Itpr2Q9Z329 2701 aa10.34□□□□□ -0.75
Eftud2-202ENSMUST00000107060 CenpwQ3URR0 86 aa10.33□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Eif4ebp3Q80VV3 101 aa10.33□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Klk11Q9QYN3 276 aa10.33□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Rpl13aP19253 203 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Znf740Q6NZQ6 180 aa10.33□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tm2d2Q8R0I4 213 aa10.32□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trav13-4-dv7A0A075B6C2 110 aa10.32□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Defb47Q30KN1 79 aa10.32□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 1700011M02RikB1AX35 88 aa10.32□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tmem223Q9CQE2 199 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cox8cA6H666 72 aa10.31□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Cops9Q3U898 57 aa10.31□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm904Q3V2L5 102 aa10.31□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Dand5Q76LW6 185 aa10.31□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 PrcdQ00LT2 53 aa10.29□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Trbv13-2A0A140T8N6 113 aa10.29□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Vmo1Q5SXG7 201 aa10.29□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tomm7Q9D173 55 aa10.28□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Lgals4Q8K419 326 aa10.28□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Tex15F8VPN2 2785 aa10.28□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Leap2Q91V13 76 aa10.28□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Gm10549Q3URY4 149 aa10.27□□□□□ -0.76
Eftud2-202ENSMUST00000107060 Prp2P05143 317 aa10.27□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 48.6 ms